玉米致病菌新月弯孢漆酶基因家族鉴定与分子结构特征分析.pdfVIP

江苏农业科学 2015年第43卷第6期 侯巨梅，崔 佳，左豫虎，等．玉米致病菌新月弯孢漆酶基因家族鉴定与分子结构特征分析[J]．江苏农业科学，2015，43(6)：32—36 doi：10．15889／j．issn．1002—1302．2015．06．008 玉米致病菌新月弯孢漆酶基因家族鉴定 与分子结构特征分析 侯 巨梅，崔 佳，左豫虎，王玉莹，赵丰舟，申永强，刘 铜 (黑龙江八一农垦大学农学院植物病理与应用微生物研究所 ，黑龙江大庆 163319) 摘要：漆酶在真菌的孢子分裂、子实体分化、黑色素生成、木质素降解酶和病菌致病中均起重要作用。采用生物信 息学的方法 ，在玉米致病菌新月弯孢基因组基础上对漆酶基因家族成员进行了鉴定和序列特征分析，结果表明玉米致 病菌新月弯孢共有8个漆酶基因，分布在6个不同的scaffolds上，其漆酶基因结构显示外显子和内含子大小与位置都 不一样 ，表现出复杂的基因结构。序列比对和系统发育分析发现 ，8个漆酶氨基酸序列与其他真菌来源漆酶一样具有 4个特征保守序列区，位于系统发育树的2个不同分支上，表明玉米致病菌新月弯孢漆酶可能与其他真菌的漆酶具有 相似的进化关系和功能。 关键词：漆酶 ；新月弯孢；基因家族；基因结构 中图分类号：$435．131 文献标志码 ：A 文章编号：1002—1302(2015)06—0032—05 漆酶是一种含铜的多酚氧化酶 ，具有较强的氧化还原能 性和系统发育进行了分析，为进一步研究漆酶基因在侵染过 力，能够氧化酚类物质 ，催化木质素的降解 ，并且促进DHN黑 程中的表达模式和作用奠定基础。 色素的合成u。J。此外，研究还发现漆酶可以影响真菌的发 1 材料与方法 育、子实体和侵染结构的形成 一 ，例如在大斑凸脐蠕孢 ( 一 serohilumturcicum)中漆酶基因被敲除后表现出黑色素合成受 1．1 漆酶蛋 白的获得 阻，不产生分生孢子，侵染能力下降等 。在隐丛赤壳菌 利用 NCBI数 据库 ，获得来 自稻梨孢 (Magnaporthe (Cryphonectriaparasitica)中漆酶与病原致病力强弱直接相 oryzae)所有漆酶氨基酸序列。从 NCBI数据库下载玉米致病 关 J。因此漆酶在病菌生长发育和致病性 中具有重要的 菌新月弯孢 (C lunata)基 因组 (http：／／www．ncbi．nlm．nih． 作用。 gov／nuccore／JFH，利用 BioEdit构建本地核苷酸 由新月弯孢 [Curvularialunata(Wakker)Boed．]引起的 和预测的蛋白质数据库。在玉米致病菌新月弯孢蛋白数据 玉米弯孢叶斑病已成为玉米主要病害之一，对我国玉米生产 库，查询来 自稻梨孢 ( oryzae)和大丽轮枝菌 (Verticillium 造成了严重的损失 。 。早期对该菌致病机制的研究发现， dahliae)的所有漆酶氨基酸序列，设其E10。。，将获得的蛋 它在离体和活体条件下可以产生一系列的细胞壁降解酶，如 白序列列为候选蛋 白质序列 (每个序列都有 固定 的号码)。 多聚半乳糖醛酸酶 (polygalactumnase，PG)、聚甲基半乳糖醛 将这些候选序列提交 到 NCBI的在线工具 CDDSearch和 酸酶 (polymethylgalacturonase，PMG)、多聚半乳糖醛酸反式消 Pfam进行保守区域分析，将其有漆酶家族保守区的序列认为 除酶 (PGTE)、果胶 甲基反式消除酶 (polygalacruronicacid 假定漆酶蛋 白，对没有漆酶家族保守区的则认为不属于该家 trans—eliminase，PMTE)和纤维素酶 (cellulose，Cx)，在病菌侵 族。利用 SIB生物信息学门户网站 (http：／／web．expasy．org／ 染早期主要产生 PG和 PMG，后期可以产生 cx 。然而