玉米MIR166基因家族的进化与功能研究.pdfVIP

南方农业学报 JournalofSouthernAgriculture 2015，46(8)：1345-1349 ISSN 2095—1191；CODENNNXAAB http：／／www．nfny~ ．tom DOI：10．3969~：issn．2095—1191．2015．08．1345 玉米MIR166基因家族的进化与功能研究 王艳芳1，赵彦宏 ，刘林德 ，周瑞莲 (鲁东大学 生命科学学院，山东 烟台 264025； 鲁东大学 农学院，山东 烟台 264025) 摘要：【目的】分析玉米M 166基因家族的序列特征、分子进化及靶基因等，了解MIR166基因家族在玉米生长发 育与逆境胁迫响应中的调控作用。 【方法 】运用生物信息学方法在miRBase中搜索zma-MIR166基因家族的序列 ，用 BLAST搜索工具进行基因定位；采用ClustalW2软件进行多序列比对 ，用MEGA6．0构建zam-MIR166家族的系统发育 进化树；利fflpsRNATarget软件对znla．M 166基因家族的靶基因进行预测。 【结果】通过搜索，在玉米中找到14个 zma-MIR166基因，并获得其对应的14个前体序列及由其产生的26个成熟miRNA序列。zlna．MIR166基因家族在产生 成熟miRNA的位置高度保守，其他位置则保守性减弱。基因定位结果发现，zlna-MIR166基因家族的14个成员分布在 染色体1、3、4、5、6、7等6条染色体上，其中以染色体1上znla．MIR166基因最多，共有5个。进化分析结果表明，14个 zlna．MIR166基因家族成员分别处于3个进化分支 ，而同处于一条染色体上的成员的亲缘关系较远。对zam-MIR166基 因家族的靶基因进行预测，发现zma．MIR166基因家族靶基因功能涉及发育调控蛋白家族、胁迫相关蛋白、光系统I作 用中心亚基、转座子插入位点等。 【结论】zam．MIR166基因家族序列保守性较高，具有明显的家族特征与相似的功 能，在玉米生长发育和胁迫响应等生物过程中发挥广泛而重要的调控作用。 关键词：玉米；MIR166；基因家族；分子进化 ；靶基因预测 中图分类号：S513 文献标志码：A 文章编号：2095—1191(2o15)08—1345—05 M olecularevolutionandfunctionofM IR166gene fam ilyinmaize WANGYan—fang ，ZHAOYan—hong ，LIULin—de，ZHOURui—lian (1SchoolofLifeSciences，LudongUniversity，Yantai，Shandong264025，China；SchoolofAgriculture， LudongUniversity，Yantai，Shandong264025，China) Abstract：O【bjective]Thecomprehensiveanalysisofsequencecharacters，molecularevolution，andtargetgenepre- dictionofMIR166genefamilyinmaizewereconductedinordertolaythefoundationforunderstandingtheirrolesinreg． ulatingthedevelopmentandadversitystressresponse．M【ethod]Thesequencesofzma-MIR166genefamilyweresearched inmiRBasebyusingbioin