茄科植物PAL基因家族的鉴定和序列分析.pdfVIP

热带作物学报 2015，36(3)：474—479 ChineseJournalofTropicalCrops 茄科植物 PAL基因家族的鉴定和序列分析 盖江涛，陈振玺，王 鹏 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所 ．海南儋州 571737 摘 要 苯丙氨酸解氨酶 (PAL，phenyIaalanineamillonia—lvase E『C：4．3．1．241)是植物次生代谢尤其是苯丙烷途径的 关键酶，与植物抵抗病原菌入侵密切相关，具有重要 的植物生理学意义 ；其催化产物是辣椒素等植物天然产物 的前体 。采用 BLASTP方法 ，依托全基 因组数据库 ，获得 了番茄、马铃薯、本 氏烟草、辣椒等 4种茄科植物及 杨树、拟南芥的PAL基 因家族成员共 27条序列 ．并对其进行初步的生物信息学分析、理化性质分析及结构分 析。结果表 明：在进化过程中，茄科植物烟草、番茄、马铃薯和辣椒 的亲缘关系较近 ，拟南芥、杨树与茄科植 物的亲缘关系较远 ：酸性蛋 白质 占96．3％，所有蛋 白均为亲水性稳定蛋 白、有 明显跨膜现象、无信号肽 ；所有 PAL亚细胞定位于细胞质中，具有活性位点的蛋 白占96．3％。本研究结果为进一步研究茄科植物 中PAL代谢机 理提供理论支持 关键词 苯丙氨酸解氨酶 ；PAL；基 因家族 ；氨基酸 ；茄科 中图分类号 0949．777．7 文献标识码 A Identification and SequenceAnalysisof PAL GeneFamily in Solanaceae GAIJiangtao，CHEN Zhenxi，WANG Peng* TropicalCropsGeneticResourcesInstitute，ChineseAcademyofTropicalAgriculturalSciences，Danzhou，Hainan57l737，China Abstract Phenylalanine ammonialyase(PAL，EC：4．3．1．24)isa criticalenzyme in secondarymetabolism of plants，which has significant biologicalrelevance and strong ability against bacteria；also， its productprovides preeumor for plantnaturalproducts such ascapsaicinoids．In this study，based on the genome database，27 peptide sequences belonging to phenylalanine ammonialyase gene family were obtained from Lycopersicon esculentum Mil1．(syn．Solarium lycopersicum L．)，Solanum tuberosum L．，NicotianabenthamianaDomin，Capsicum annuum L．，PopulustrichocarpaLandArabidopsistholiana(L．)HeynhbyBLASTP，andanalysedbybioinformatics， physico—chemical properties，structuralanalysis．The analysis showed thattobacco，tomatoes，potatoes and peppem have close genetic relationship，thenArabidopsisthaliana,poplarisfurtherin evolution．Acidicprotein is96-3％． AllPAL proteinsrae locatedin cytoplasm，hydrophilic，stable，transmembrane，nosignal，and 96-3％ ofthe protein h