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_蛋白质的三维结构资料.ppt

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蛋白质变性的过程中,往往发生下列现象: 1)生物活性的丧失 2)一些侧链基团的暴露 3)一些物理化学性质的改变:①溶解度降低;②分 子形状发生改变,不对称性增加,黏度增减,旋光和紫外吸收变化 4)生物化学性质的改变:易被酶水解 Protein denature 变性剂:尿素和盐酸胍,能与多肽主链竞争氢键,因此破坏蛋白质的二级结构。十二烷基硫酸钠(SDS)。 关于蛋白质变性的学说,我国生物化学家吴宪在20世纪30年代就已提出,天然蛋白质分子因环境的种种关系,从有序而紧密的结构,变为无序而松散的结构,这就是变性。 Protein denature 当变性因素去除后,变性蛋白质又可重新恢复到天然构象,为蛋白质的复性 Protein denature 5.9.2 氨基酸序列 规定蛋白质的三维结构 Amino acid sequence determine protein 3-dimenational structure 5.9.2.1 核糖核酸酶的变性和复性实验 牛胰核糖核酸酶(RNA酶)有4个二硫键 8mol/L尿素或6mol/L盐酸胍+巯基乙醇 酶 无规线团 透析除去变性剂和巯基乙醇 Amino acid sequence determine protein 3-dimenational structure Amino acid sequence determine protein 3-dimenational structure 8个SH重新氧化,随机重组形成 4个正确配对二硫键的概率=1/7*1/5*1/3=1/105 当还原后的RNA酶在8mol/L尿素中被重新氧化时,只恢复到原来天然活性的1% 左右。 Amino acid sequence determine protein 3-dimenational structure 5.9.5 蛋白质结构的预测 Calculation of protein structure 5.9.5.1 二级结构的预测 (自学) Secondary structure calculation 5.9.5.2 三级结构的预测----折叠的计算机模拟(自学) 3-dimensional calculation --- computer simulate protein fold 5.10 亚基缔合和四级结构 Subunits 结合conjection Protein Quaternary structure 5.10.1 concepts relate to quaternary structure 亚基(subunit)\单体( monomer) 单体蛋白质 寡聚蛋白(oligomer) 原聚体(protomer) 同多聚(homomultimeric)蛋白质 杂多聚(heteromultimeric)蛋白质 亚基缔合和四级结构 蛋白质的四级结构涉及 ①亚基种类和数目 ②各亚基和原聚体在整个分子中的空间排布 亚基缔合和四级结构 5.10.2 四级缔合的推动力 亚基缔合和四级结构 Van der Waals forces Hydrogen bond Ionic interactions Hydrophobic interaction Disulfide bond 具有四级结构的蛋白质的有关概念: 结合在蛋白质分子的特定部位上的配体对该分子的其他部位所产生的影响(如改变亲和力和催化能力)称为别构效应(allosteric effect)。 具有别构效应的蛋白质称为别构蛋白质。 别构效应中亚基之间的信息传递是通过蛋白质构象的变化实现的,别构效应具有协同性(cooperativity)。 别构效应分为同促效应和异促效应。 同促效应包括正协同性和负协同性。 4-5蛋白质的共价结构,三维结构作业 名词解释: 单纯蛋白(举例),缀合蛋白(举例), 辅基,配体, 蛋白质的一、二、三、四级结构, 超二级结构,结构域, 肽平面(酰胺平面),谷胱甘肽(结构式),对角线电泳,完全水解,部分水解, 同源蛋白质,不变残基,可变残基, α-螺旋 β-折叠,膜内在蛋白, 蛋白质的变性与复性, 单体,同聚体,杂多聚蛋白 ? ? 回答问题: 1.????? 试举例说明蛋白质功能的多样性? 2.????? 哪些实验能

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