甘蔗SCL25基因的克隆及生物信息学分析.pdfVIP

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2016-05-12 发布于安徽
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甘蔗SCL25基因的克隆及生物信息学分析.pdf

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生物技术通报 ·研究报告· BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2013年第11期甘蔗 SCL25 基因的克隆与生物信息学分析 1 1，2 2 1 1 2 1 刘娟吴嘉云刘少谋邓祖湖廖振阳符成李虎 2 1 1 黄忠兴林彦铨陈如凯（1. 农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室，福州 350002 ；2. 广州甘蔗糖业研究所，广州 510316）摘要：结合电子克隆及RT-PCR 获得了甘蔗（ spp. ）花穗中表达的一个SR 基因成员。该基因cDNA 全长960 bp ， Saccharum 包含编码209 个氨基酸的开放读码框，gDNA 序列长2 966 bp ，包含5 个内含子。同源性比对表明ScSCL25 属于SCL 亚家族，命名为（gb ：JQ031566 ）。应用生物信息学工具分析表明：编码蛋白为不稳定亲水性蛋白，含有33 个潜在磷酸化位 ScSCL25 ScSCL25 点；无信号肽无跨膜结构域，亚细胞定位于细胞核。该蛋白含有SR 基因典型的RRM 结构域和SR 富集结构域，与玉米等作物的 SR 蛋白具有较高的同源性。关键词：甘蔗 ScSCL25 基因克隆生物信息学 - Cloning and Bioimformation Analysis of a Serine / Arginine Rich . Protein Gene SCL25 in Saccharum spp 1 1，2 2 2 1 2 1 Liu Juan Wu Jiayun Liu Shaomou Deng Zuhu Liao Zhenyang Fu Cheng Li Hu Huang Zhongxing2 1 1 Lin Yanquan Chen Rukai （1. Key