基于COI序列快速鉴定花蓟马的DNA条形码芯片初探.pdfVIP

生物技术通报 ·研究报告 · B IO TECHN OLO G Y　BULL E T IN 2009年第 8期 基于 CO I序列快速鉴定花蓟马的 D NA 条形码芯片初探 冯毅 　王莉 　白云峰 　王洁 　冯纪年 (西北农林科技大学植保资源与病虫害防治教育部重点实验室 ,杨凌 7 12 100) 　　摘 　要 : 　利用 DNA 条形码信息研制 DNA 芯片 ,建立快速高效的花蓟马鉴定方法 。以 3种花蓟马属 ,共 9个样本的 CO Ⅰ基因片段序列为研究材料 ,应用软件 Prim er Prem ier5搜索出 9个样本的 12种 motif基因序列 ,应用这 12种 motif序列制作虚 拟 DNA 条形码芯片 。虚拟电子杂交 20个样本的 CO Ⅰ基因片段序列 。结果显示 ,设计的虚拟 DNA 芯片能够鉴定本研究中的 3种花蓟马 ,利用 DNACO Ⅰ基因片段 ,设计 DNA 芯片在理论上可行 。 关键词 : 　CO Ⅰ基因　DNA 条形码 　DNA 芯片 　花蓟马 M olecular Iden tif ica tion of F rank lin iella Ba sed on CO ⅠSequences by D NA Barcod ing Ch ip Feng Yi　W ang L i　B ai Yunfeng　W ang J ie　Feng J in ian ( Key L abora tory of P lan t P rotection and P estM anag em en t , M in istry of E duca tion E n tom ology M useum , N orthw est A F Un iversity , Yang ling 7 12 100 ) 　　Ab s tra c t: 　A qu ick m ethod of F rank lin iella identification by DNA ch ip that ba sed on the DNA barcoding inform ation was estab lished. N ine CO Ⅰgene p artial sequence s of three sp ecie s of F rank lin iella were ob tained. Twelve Motif sequences of the n ine samp le s were searched by the software Prim er Prem ier5. Simu lated DNA ch ip were m ade acorrding to the twelve Motif sequence s. CO Ⅰgene p artial sequence s of twen ty samp les were hyb ridized w ith the Sim u lated DNA ch ip. It wa s showed that DNA barcode ch ip can identify the there sp icies of F rank lin iella. Integrating the DNA barcode and DNA ch ip is feasib le in theory. Key w o rd s: 　Gene CO Ⅰ　DNA barcode　DNA ch ip 　F rank lin iella ( ) 　　花蓟马属 F rank lin iella Karny 隶属于缨翅 目 因部分