河西绒山羊GOLA-DRB1基因第2外显子变异特征分析.pdfVIP

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2016-05-12 发布于安徽
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河西绒山羊GOLA-DRB1基因第2外显子变异特征分析.pdf

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生物技术通报 ·研究报告· BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2011年第12期 - 河西绒山羊 GOLA DRB1 基因第 2 外显子变异特征分析 1 1,2 1,2 2 1,2 王佳泰王继卿胡江马小军罗玉柱 1 2 （甘肃农业大学动物科学技术学院，兰州 730070 ；甘肃省草食动物生物技术重点实验室研究测试中心，兰州 730070） - - 摘要: 采用 PCR SSCP、克隆测序等方法，分析 600 只河西绒山羊 GOLA DRB1 基因第 2 外显子遗传特征、SNPs 变异类型，同时分析该基因与山羊流产的关联性。结果表明，河西绒山羊 DRB1 基因第 2 外显子上存在 26 个等位基因，序列比对后发现 26 个等位基因中存在 71 个核苷酸变异位点，占分析位点总数的 30 ％。其中转换位点 25 个，占核苷酸多态位点的 35.21 ％；颠换位点 35 个，占核苷酸多态位点的 49.3 ％；转换和颠换共存位点 9 个，占 12.68％。山羊流产关联性分析结果表明，在河西绒山羊 * * * χ2 值分别为 6.31 ，4.859 ，6.396 ，RR 值为 2.55 ，病例组中 DRB1 18、DRB1 23、DRB1 26 等位基因频率高于正常对照组（P0.05 ）， 2.72 ，DRB1*8 等位基因频率显著高于正常对照组（P0.01 ），χ2 值为 17.618，RR 值为 3.59 ；病例组中 DRB1*14 等位基因频率低于正常对照组（ 0.05 ），χ2 值为 4.812 ，RR 值为 0.65 ，DRB1*1 和 DRB1*11 显著低于正常对照组（P0.01 ），其中 B1 的 χ2 值和 P RR 值分别为 14.11 和 0.61 ，初步推断 DRB1*8 可能是河西绒山羊流产发病单体型中的遗传易感基因，DRB1*1 和 DRB1*11 可能为其遗传保护基因。 - 关键词: DRB1 基因 PCR SSCP 流产河西绒山羊 - Variation of the GOLA DRB1 Gene Exon 2 in Hexi Cashmere Goa