大豆细胞质基因组单倍型及相互间的演化关系.pdfVIP

摘要 摘要 本文选择我国有代表性的野生大豆和栽培大豆地方品种为材料，研究大豆 细胞质基因组DNA序列多样性及其在栽培驯化过程中的演变规律。旨在进一 步了解大豆栽培驯化的分子过程，为揭示大豆起源与进化的分子机理提供必要 的研究基础。主要结果如下： 550 片段的DNA序列进行了分析。cpDNA铡序总长14bp，共发现39个多样 性位点：包括34个单碱基替换、3个单碱基插入缺失和2个多碱基插入缺失。 532 mtDNA测序总长3 bp，仅在野生大豆群体内发现了1个SNPs，核苷酸多 样性0值为0．00007。结果表明野生大豆拥有非常丰富的遗传多样性；对野生和 栽培大豆cpDNA的SNPs次等位基因频率分布研究发现，野生大豆中存在大量 换，转换与颠换的比值为1：16，表明大豆cpDNA中存在着严重的“颠换偏差”。 2 cpDNA39个多样性位点组成28种单倍型，野生大豆和栽培大豆单倍型 分别有23种和8种。野生大豆群体特有单倍型20种，栽培大豆群体特有单倍 型5种。与群体多样性位点所反应的情况一样，野生大豆拥有非常丰富的遗传 多样性。从平均和整体多样性水平看，野生大豆与栽培大豆群体内的单倍型多 著地高于栽培大豆(P=o．001)。表明，从野生大豆向栽培大豆进化的过程中， 单倍型多样性明显减少。对野生大豆和栽培大豆epDNA的连锁不平衡强度进 与野生大豆相比，栽培大豆的连锁不平衡强度较强，为野生大豆的2．4l倍。对 28种单倍型构建了cpDNA单倍型网络结构图，通过比较野生和栽培大豆不同 cpDNA单倍型之间的演化关系，发现在从野生大豆到栽培大豆驯化的过程中， 至少存在三支不同的相对独立的演化途径。3种不同单倍型6、12、和10的栽 培大豆可能独立起源于各个不同地区的不同单倍型的野生大豆，其中单倍型10 摘要 为最重要的一支演化途径。结合单倍型的地理分布可以推断出：我国栽培大豆 为多起源中心，包括黄淮、长江和中南三个初生驯化中心和北方和华南两个次 生驯化中心。 关键词：大豆；叶绿体基因组；线粒体基因组；单核苷酸多态性；单倍型；连 锁不平衡 Il Absttact ABSTRACT chosenfor WildandcultivatedwitlI were soybeangeographicalrepresentative theruleofits the ofthe and study soybearlcytoplasmicgenomegeneticpatterns domesticationonDNA leveltolearnthemolecular changeduring process sequence of domesticationandthemolecularmechanismof processsoybcan soybeanorigin as andevolution．Themainresultsarefollows： I five and6mtDNA been TwentycpDNA