胆固醇酯转运蛋白抑制剂的3d-qsar模型.pdfVIP

物理化学学报(Wuli Huaxue Xuebao) December A cta Phys. Chim. Sin., 2008, 24(12) ：2249-2256 2249 [Article] 胆固醇酯转运蛋白抑制剂的3D QSAR 模型 琳芳 胡桂香 徐 晶 赵文娜 俞庆森 (浙江大学宁波理工学院分子设计与营养工程市重点实验室, 浙江宁波 315100) 摘要: 利用VolSurf 参数和比较分子场分析(CoMFA)方法对N,N 二取代三氟 3 氨基2 丙醇衍生物类胆固醇酯 转运蛋白抑制剂进行了三维定量构效关系(3D QSAR)模型研究, 均得到较好的结果, 训练集模型具有良好的预 测能力. VolSurf 参数分析表明抑制活性高的分子必须具有合适的亲水性、多的氢键给体和少的氢键受体; 在一 范围内, 分子量大、表面光滑且非球性高的分子抑制活性高; 高疏水性以及质量中心与疏水区中心的高不平衡 性对活性是不利因素. CoMFA 结果表明, 立体作用对活性的影响较静电作用稍强, N 苯基取代基苯氧基的间位 体积大且正电性强的基团对活性有利, N 苄基取代基的间位体积大且合适的电负性对活性有利, 而苄基的对位 立体位阻的增加则对活性不利. VolSurf 参数提供了分子整体性质信息, CoMFA 提供了取代基信息, 两者互为补 充, 对该类抑制剂新化合物的设计具有指导意义. 关键词: 胆固醇酯转运蛋白; 抑制剂; VolSurf; CoMFA; 3D QSAR 中图分类号: O641 3D QSAR Models on Cholesteryl Ester Transfer Protein Inhibitors YAN Lin Fang HU Gui Xiang* XU Jing ZHAO Wen Na YU Qing Sen (Key Laboratory f or Molecular Design and Nutrition Engineering of Ningbo City, Ningbo Institute of Technology, Zhej iang University, Ningbo 315100, Zheji ang Province, P. R. China) Abstract: A three dimensional quantitative structure activity relationship (3D QSAR) study was performed on a series of CETP inhibitors N,N disubstituted trifluoro 3 amino 2 propanol derivatives using VolSurf descriptors and the comparative molecular field analysis (CoMFA) method. Good results were obtained and the training set was predictable for the test set. VolSurf descriptor analysis showed that suitable hydrophilicity, more hydrogen bond donors and less acceptor were favorable to activity. T