核酸化学分析.ppt

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第二章 核酸化学 核酸化学 第一节 核酸通论 第一节 核酸通论 核酸的种类和分布 5′-磷酸核苷酸的基本结构 稀有核苷 常见(脱氧)核苷酸的结构和命名 2 细胞内游离核苷酸及其衍生物 腺苷酸及其多磷酸化合物 cAMP(cGMP)的结构 第三节 DNA的结构 DNA、RNA的一级结构 (一)DNA 的一级结构 DNA一级结构的表示法 (二)DNA的二级结构 2、 DNA的双螺旋结构 (1)DNA的双螺旋结构的形成 (2)DNA的双螺旋模型特点 (2)DNA的双螺旋模型特点 3 DNA的双螺旋结构稳定因素 4 DNA的双螺旋结构的意义 三种DNA双螺旋构象比较 (三)DNA的三级结构 螺旋和超螺旋电话线 DNA超螺旋结构的形成 动物病毒切面模式图 组蛋白与DNA的结合 核小体盘绕及染色质示意图 真核生物染色体DNA组装不同层次的结构 DNA超螺旋结构形成的意义 第四节 RNA的结构 (三)rRNA的结构 (四)mRNA的分子结构 原核细胞mRNA的结构特点 真核细胞mRNA的结构特点 第五节 核酸的性质 分子杂交的原理示意图 Southern印迹法 1、热变性的DNA分子在适当条件下可以复性,条件之一是( ) A、骤然冷却???? B、缓慢冷却???? C、浓缩???? D、加入浓的无机盐 2、tRNA的分子结构特征是( ) A、有反密码环和 3’—端有—CCA序列???? B、有密码环??? C、有反密码环和5’—端有—CCA序列??? D、5’—端有—CCA序列 3、下列关于DNA分子中碱基组成的定量关系哪个是不正确的?( ) A、C+A=G+T???? B、C=G???? C、A=T???? D、C+G=A+T (一)一般理化性质 性状:DNA为白色纤维状固体,而RNA为白色粉末。 溶解度:DNA和RNA均不溶于一般的有机溶剂,微溶于水, 但它们的钠盐在水中溶解度较大。 DNA溶液的黏度比RNA溶液大的多。 (二)核酸的水解 1 酸水解 核酸分子内糖苷键和磷酸二酯键对酸的敏感程度不同。 2 碱水解 DNA和RNA对碱的耐受程度有很大差别。 例如,在0.1 mol/L NaOH溶液中,RNA几乎可以完全水解,生成2′或3′核苷酸;DNA在同样条件下则不受影响。这种水解性能上的差别,与RNA核糖上2′-OH的邻基参与作用有很大的关系。在RNA水解时,2′-OH首先进攻磷酸基,在断开磷酯键的同时形成环状磷酸二酯,再在碱的作用形成水解产物。 DNA一般对碱稳定,RNA对碱不稳定。 3 酶水解 按作用的底物分为核糖核酸酶(RNAase)和脱氧核糖核酸酶 (DNAase) 根据作用方式又分为两类:核酸外切酶和核酸内切酶。 核酸外切酶的作用方式是从核苷酸链的一端(3′端或5′端)开始,逐个水解切除核苷酸;核酸内切酶的作用方式刚好和外切酶相反,它从核酸链的内部开始,在某个位点切断磷酸二酯键。 在分子生物学研究中最有应用价值的是限制性核酸内切酶。这种酶可以特异性的水解核酸中某些特定碱基顺序部位。 按核酸水解的键不同,可分为核酸酶和N糖苷酶。 (三)核酸的酸碱性质 两性解离的性质 等电点偏酸性 (四)核酸的紫外吸收 在核酸分子中,由于嘌呤碱和嘧啶碱具有共轭双键体系,因而具有独特的紫外线吸收光谱,最大吸收峰波长(λmax)在260nm处,可以作为核酸及其组份定性和定量测定的依据。 1 天然DNA 2 变性DNA 3 核苷酸总吸收值 220 240 260 280 0.1 0.2 0.3 0.4 波长(nm) 光吸收 1 2 3 (四)核酸的紫外吸收 首先根据A260/A280的比值判断核酸样品的纯度 纯DNA:A260/A280=1.8 纯RNA:A260/A280=2.0 (若样品中含有杂蛋白或苯酚,则A260/A280比值明显降低) 纯的核酸样品可根据260nm的光吸收值算出其含量 若260nm光吸收值为1相当于50μg/ml双螺旋DNA 或相当于40μg/ml单链DNA或RNA 或相当于20μg/ml寡核苷酸 增色效应:核酸发生变性时,摩尔磷消光系数增加的现象。 减色效应:复性后,摩尔磷消光系数又降低的效应。 磷摩尔消光系数 (五)DNA的变性、复性与杂交 1 DNA的变性 在物理、化学因素影响下, DNA碱基堆积力和碱基对之间的氢键受到破坏,双螺旋解开,从而引起理化性质及生物学功能的改变,这种现象称为核酸的变性。 变性核酸将失去其部分或全部的生物

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