分子生物学基本操作分析报告.pptVIP

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分子生物学基本操作 手套 原则上不论什么实验都应带手套操作 特别是 无菌操作; 与RNA有关的所有操作; 重要克隆菌的挑单克隆,扩增,保存等 与有毒试剂有关的所有操作,比如染胶时的EB;提取用的有机试剂(通风橱); Pipett 枪头 加样-使用合适的枪与枪头 比如加含有甘油的试剂,酶等最好用clear Tips 它不会有残留; 如果甘油含量高,或特别浓稠的试剂最好用Clear, Non-Beveled Tips(或将一般枪头去尖头); 与RNA操作有关的枪头最好为Sterilized Micro-filter Tips,或者至少为用DEPC水处理的枪头; 加样体积应为枪头最大体积的20%-100%,低于该范围的用小一号的枪头;大于该范围的可以用同样的枪头加样两次(两次体积相当,比如加210ml, 可以用200ml枪头以105ml加两次); 加样 加用任何试剂前要将试剂混合(除饱和酚,或一些特别的有机试剂) 加样的枪头应在试剂的中间表层吸收,防止枪头外壁带用过多试剂,改变加样实际体积(除饱和酚外,一定要伸到tris饱和液下的酚中) 加样酶(冰上)时,应注意体积准确,及外壁不带,内壁吹打干净,注意用枪头从反应体系的管底吸上,反复吹打 多通道枪 混匀----所有试剂在使用前都要充分混匀; 多数分子操作在加样后、反应前都要充分混匀 水浴 提前10-30分钟调好温度;稳定后才能使用; 水位不可以低于水浴锅高度的50% 用合适浮子; 定时; 使用后需要添水或换水 关闭电源 离心 离心前,如果需要预冷,至少预冷15分钟。盖好管盖,充分混匀; 质量对称放置; 不合适的离心管应外套其他型号的管子;如离心0.2管,最好是放在0.5管套1.5管中;如短暂离心可以放在1.5管中; 盖上离心机的内盖 离心后,如果要移动,放在试管架上移动,防止破坏液面; 短暂离心要在3000-8000rpm范围内;时间应短于30秒; 如果离心机被有机试剂或其它样品污染当事人应及时清理 细菌DNA的提取 环状双链DNA、不与组蛋白结合(古菌具有组蛋白类蛋白)、基因总数水平一般为103-104,一般情况下,一个细胞中只有一条染色体或一套基因组。 DNA的提取过程就是用化学和物理的方法,使DNA与其他细胞物质分离开来的过程。 一般本实验室采用的有高盐法,CTAB法,煮沸法。 本次实验采用SDS高盐沉淀法。 菌株划LB平板活化,挑单菌落,接3ml 试管,于30℃剧烈振荡培养过夜至稳定期。离心收集菌体1ml,然后用等体积TEN洗涤菌体,离心收集菌体,悬浮于等体积TEN中。 加入200ul溶菌酶(100mg/ml),37℃水浴1h,再加入300ul 20%的SDS,37℃水浴至溶液澄清。** 加入1/3体积饱和NaCl剧烈振荡,12000 rpm离心10min。我们的实验中上清就取1ml,以方便后续实验。 上清用等体积酚抽提1次, 12000 rpm离心10min,小心地吸取上清。 上清再用等体积的酚:氯仿抽提1次, 12000 rpm离心10min,收集上清。 上清再用等体积的氯仿抽提1次,收集上清。 上清中加入等体积TE(稀释调整NaCl浓度),0.6倍体积异丙醇沉淀,12000 rpm离心10min,70%乙醇洗涤沉淀,乙醇挥发后溶于100ul TER中,取1ul电泳检测,其余的-20℃保存备用。 琼脂糖凝胶电泳 和凝胶成像实验步骤 1、具体步骤 ?1 打开凝胶成像仪电源(机器后部),开电脑; ?2 将染色后凝胶用水冲洗后,将凝胶放在透射板正中, 并关严暗仓门,打开紫外灯; ?3 打开Quantity one软件,点击basic,File中选择 Get Doc EQ…,调节使图象到达合适亮度、大小及清晰度; ?4 待图象最优化时,成像freeze在屏幕上,关闭紫外灯, 点击“Save”保存; ?5 关闭软件; ?6 打开暗仓门,拉出透射台,凝胶丢弃至专门垃圾桶, 插掉透射板上水迹; ?7 关上暗仓门。 2、Quantity One 软件 是The Discovery Series 软件家族的成员,它是一 个功能强大的灵活软件包,可成像和分析一维电泳凝胶、斑点印迹、狭线 印迹和菌落计数。 Quantity One 软件能定量和分析多种数据,包括从光密 度仪、储能磷屏成像仪、荧光成像仪和凝胶成像系统采集的放射性、化学 发光、荧光和染色等样品。Quantity One提供自动分析功能以快速获取高 质量结果。 3、注意事项 ?1 开关仓门时防止将EB沾在仓门盖上; 2 透射板紫外灯寿命有限,调整图象后及时成像; ?3 凝胶应及时清理,防止凝胶固化后贴附在透射板上,造成成像不清晰; 4 成像结束后插掉透射板上水迹,防止仪器内部生锈引起

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