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第四章从mRNA到蛋白质分析

生物信息的传递(下) ——从mRNA到蛋白质 翻译(translation): 即蛋白质生物合成,是将核酸中由 4 种核苷酸序列编码的遗传信息,通过遗传密码破译的方式解读为蛋白质一级结构中20种氨基酸的排列顺序 。 主要内容 第一节 蛋白质生物合成体系 第二节 蛋白质生物合成过程 第三节 蛋白质合成后加工和运转机制 1. 遗传密码——三联子 (一)定义 遗传密码表 (二)遗传密码的性质 从mRNA 5?端起始密码子AUG到3?端终止密码子之间的核苷酸序列,各个三联体密码连续排列编码一个蛋白质多肽链,称为开放阅读框架(open reading frame, ORF)。 密码子、反密码子配对的摆动现象 3. 核糖体 在单个核糖体上,可化分多个功能活性中心,在蛋白质合成过程中各有专一的识别作用和功能。 ● mRNA结合部位——小亚基 ● 结合或接受AA-tRNA部位(A位)——大亚基 ● 结合或接受肽基tRNA的部位——大亚基 ● 肽基转移部位(P位)——大亚基 ● 形成肽键的部位(转肽酶中心)——大亚基 蛋白质生物合成过程 氨基酸活化 肽链的起始、伸长、终止 新合成多肽链的折叠和加工 氨基酰-tRNA合成酶对底物氨基酸和tRNA都有高度特异性。 氨基酰-tRNA合成酶具有校正活性(proofreading activity) 。 氨基酰-tRNA的表示方法: Ser-tRNASer Met-tRNAMet tRNA与酶结合的模型 指mRNA和起始氨基酰-tRNA分别与核蛋白体结合而形成翻译起始复合物 。 (2)30S 小亚基通过SD序列与 mRNA模板相结合 真核生物翻译起始的特点 ● 核糖体较大,为80S; ● 起始因子比较多; ● mRNA 5′端具有m7Gppp帽子结构 ● Met-tRNAMet ● mRNA的5′端帽子结构和3′端polyA都参与形成翻译起始复合物; 真核生物翻译起始复合物形成 (区别原核生物) 原核生物中30S小亚基首先与mRNA模板相结合,再与fMet-tRNAfMet结合,最后与50S大亚基结合。而在真核生物中,40S小亚基首先与Met-tRNAMet相结合,再与模板mRNA结合,最后与60S大亚基结合生成80S·mRNA·Met-tRNAMet起始复合物(P124)。 肽链延伸由许多循环组成,每加一个氨基酸就是一个循环,每个循环包括:AA-tRNA与核糖体结合(进位)、 肽键的生成(成肽)和 移位(转位)。 延伸过程所需蛋白因子称为延长因子(elongation factor, EF) 原核生物:EF-T (EF-Tu, EF-Ts) EF-G 真核生物:EF-1 、EF-2 (1)AA-tRNA与核糖体A位点的结合 (2)肽键形成 是由转肽酶/肽基转移酶催化 (3)移位 核糖体向mRNA3’端方向移动一个密码子。 需要消耗GTP,并需EF-G延伸因子 延长因子EF-G有转位酶( translocase )活性,可结合并水解1分子GTP,促进核蛋白体向mRNA的3侧移动 。 多聚核蛋白体(polysome) 蛋白质合成后加工和运转机制 主要包括 一)蛋白质前体的加工 1、N端fMet或Met的切除 2、二硫键的形成 3、特定氨基酸的修饰 4、切除新生肽链中非功能片段 2)二硫键的形成 mRNA中没有胱氨酸的密码子,蛋白质中的二硫键是通过两个半胱氨酸的-SH基氧化生成的 二)蛋白质合成抑制剂 1、翻译-运转同步机制 信号肽假说 ●信号肽:常指新合成多肽链中用于指导蛋白质跨膜转移的N-末端氨基酸序列(有时不一定在N端),长度一般在13~36个残基之间。 ●信号序列特点: (1)一般带有10-15个疏水氨基酸; (2)在靠近该序列N-端常常有1个或数个带正电荷的氨基酸; (3)在其C-末端靠近蛋白酶切割位点处常常带有数个极性氨基酸,离切割位点最近的那个氨基酸往往带有很短的侧链(丙氨酸或甘氨酸)。 复习体 1. 多数氨基酸都有两个以上密码子,下列哪组氨基酸只有一个密码子? A.苏氨酸、甘氨酸 B.脯氨酸、精氨酸 C.丝氨酸、亮氨酸 D.色氨酸、甲硫氨酸 E.天冬氨酸和天冬酰胺 2.tRNA分子上结合氨基酸的序列是 A.CAA-3′ B.CCA-3′ C.AAC-3′ D.ACA-3′ E.AAC-3′ 3.遗传密码 A.20种氨基酸共有64个密码子 B.碱基缺失、插入可致框移突变 C.AUG是起始密码 D.UUU是终止密码

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