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一、λ噬菌体的分子生物学
第三节λ噬菌体载体
λ噬菌体的生活史
λ噬菌体基因大致分为4个区:
结构区A~ J19个基因,编码头、 尾部蛋白质为结构区,重组区 att(attachment)、int(intagrate)及xis(excission),调控区启动子、终止子和NuI基因, O-R 为裂解区。
1 ? 噬菌体发育调节
①吸附 ②立即早期转录 ③ 延迟早期转录 ④溶源和裂解的感染分化 ⑤进入裂解生长 ⑥溶源化
? 噬菌体的可取代区
J 基因与 Cro 基因之间的 DNA 被 ga1 基因或 bio 基因替换后,不影响 λ 噬菌体裂解生长。这个区段约占λ噬菌体 DNA 的 1/3 ,主要包含控制λ噬菌体进入溶源状态的调节基因和功能基因
2 λ噬菌体载体的选择标记
2.1 基因组大小
重组λ噬菌体的基因组 DNA 太大或太小会影响其存活能力。外源 DNA 片段的大小将在 9-23kb 范围内
2.2 lacZ 基因
?lacZ 基因也可用于 λ 噬菌体载体,通过插入或替换载体中的 β-半乳糖苷酶基因片段,在 IPTG/X-gal 平板上可通过噬菌斑的颜色,筛选重组噬菌体
λ噬菌体载体的选择标记
2.3 基因 cⅠ 失活
基因 cⅠ 是 λ 噬菌体的抑制基因,全面抑制并阻断基因的表达 。如果外源 DNA 片段插入基因 cⅠ 中,将高频率地使 E.coli 进入裂解生长状态。
2.4 Spi 筛选
通过λ噬菌体载体 DNA 上的 red 和 / 或 gam 基因的缺失或替换,可在 P2 噬菌体溶源性细菌中鉴别重组和非重组λ噬菌体。
3.代表性λ噬菌体载体
3.1 插入型载体
通过特定的酶切位点允许外源 DNA 片段插入的载体称为插入型载体。由于 λ 噬菌体对所包装的 DNA 有大小的限制,因此一般插入型载体设计为可插入 6kb 外源 DNA 片段,最大 11kb 。
?
λgt10载体
大小为 43340bp ,是经典的 ? 噬菌体载体,主要用作 cDNA 克隆,允许的插入片段大小为 0-6kb 。
?gt11 载体
大小为 43.7kb ,是一个常用的载体。?gt11 载体允许插入的 DNA 片段大小为 0~7.2kb 。它用于构建 cDNA 文库、基因组文库和表达融合蛋白。
该载体最大的特点是在最左侧可替代区置换了一段 lac5 基因,可编码 ?-半乳糖苷酶,在 IPTG/X-gal 平板上形成兰色噬菌斑。
lac5 基因编码区终止密码子之前有一个 EcoRⅠ 位点(53bp 上游),可用于外源 DNA 片段的插入。
筛选时,在 lac- 宿主菌中非重组噬菌斑为兰色。当外源 DNA 片段与 lacZ 的阅读框相吻合时,可表达出融合蛋白,可用免疫学方法筛选阳性重组子。
?GEM-2/4
?GEM-2 和 ?GEM-4都是由 ?gt10 改造而来,也是 cDNA 克隆载体
?ZAPⅡ?????ZAPⅡ 整体上与 ?gt11 相似,不同的是在基因 J 和 att 位点之间用 pBluescript SK 质粒片段取代了相应的 ? 噬菌体片段,允许插入 0-10kb 的外源片段。因此,该载体具备了 pBluescript SK 质粒的一些特性,如 ?-互补以及可通过启动子合成 RNA 探针。
?Excell?????Excell 大小为 45.5kb ,与 ?ZAPⅡ 相似。不同的是,在该载体中装载了 pExCell 质粒载体片段(4190bp)。该载体允许外源 DNA 插入的大小为 0-6kb ,主要用于 cDNA 克隆。 pExCell 与 pBluescript 载体相似,除了多克隆位点不同外,插入了一段来自 ? 噬菌体的片段。该片段含有 ? 噬菌体整合到大肠杆菌染色体所必须的整合位点 att 。
3.2 置换型载体
允许外源 DNA 片段替换非必须 DNA 片段的载体,称为置换型载体(replacement vectors)。一般情况下,置换型载体克隆外源片段的大小范围是 9-23kb ,故而该载体主要用来构建基因组文库。
EMBL3 和 EMBL4
? 这两个载体大小为 43kb ,其左臂、右臂和填充片段的大小分别为 20kb、 9kb 和 14kb 。从提高克隆效率角度来看,它们克隆 DNA 片段的大小为 9-23kb 。在填充片段中带
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