生物信息学第3章动植物基因组测序项目课件.ppt

与我们息息相关的人类基因组序列 番茄基因组测序的目的和意义 1、解析番茄的果实发育机制，为培育具有高产、优质、抗病虫害、抗逆等优良性状的番茄新品种奠定良好基础，对推动全世界番茄生产有重要意义。同时，基因组序列的获得为在育种中进一步利用野生资源的优异基因提供出有力工具。 2、对于不同物种之间的比较基因组学研究具有重要价值，将极大推动番茄乃至包括马铃薯、辣椒、茄子等茄科植物的功能基因组研究，比较基因组学研究，为其它茄科植物的研究提供基因组序列，解释为什么亲缘关系接近的茄科物种之间存在巨大的外在差异 番茄基因组测序计划 2003年11月，在华盛顿，组建由中、美等14国科学家组成的番茄基因组研究国际协作组，开始番茄全基因组的测序工作（华盛顿会议）。 2012年5月，番茄基因组序列发表在《Nature》杂志。对栽培番茄和醋栗番茄全基因组的序列测定，是继拟南芥和水稻基因组序列分析之后，科学家通过国际合作完成的又一个高质量模式植物基因组序列分析。 番茄基因组测序计划 番茄基因组（950Mb）中大约3/4（730Mb）是异染色体;占基因组1/4，约220Mb的常染色质多集中分布于染色体的两极，这些常染色体区域包含了超过90%的番茄基因和几乎所有的单拷贝基因。 SOL计划的第一步就是对番茄常染色体区进行测序。 番茄基因组测序计划 番茄基因组测序计划 普通栽培番茄有约9亿个碱基对，共鉴定出约3