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胃癌特征性循环microRNA组合模式的建立及应用研究金华市人民医院消化科 施莉一、立项研究内容二、研究工作情况三、取得的技术、经济、社会效益分析四、存在问题和前景预测背景全球每年约150万新发胃癌病例,引起近50000人死亡血清肿瘤标志物,如CEA、CA19-9对早期大肠癌诊断的敏感性和特异性尚不足。内源性小RNA,即miRNA在血清中非常稳定,能区分肿瘤患者和非肿瘤患者的潜在能力,miRNA的表达水平和肿瘤的临床病理特征及肿瘤预后相关,能准确判断其组织来源、对组织学上难以诊断的低分化肿瘤进行分类。目前的研究通常是基于肿瘤组织的miRNA表达谱的研究,因此较难用于肿瘤的早期筛选。术前肿瘤组织的获得具有一定的创伤性,也限制了其在临床诊断中的应用。目的本研究应用实时定量PCR芯片结合定量PCR证,检测胃癌患者血清中特异相关miRNA,探讨候选miRNA作为胃癌诊断标志物的可行性。 立项研究内容筛选胃癌相关microRNA建立外周血循环miRNA的检测方法检测并分析microRNA在胃癌诊断中的价值收集胃癌患者和正常对照者外周血标本 研究方案(1) 招募研究对象,即临床诊首次断胃癌并未接受手术以及放化疗的患者和健康对照者,签署知情同意书,采集5ml外周血。(2) 采用Trizol-LS分离血浆/血清总RNA,加入RNA保护液于-80℃冰箱保存。(3) 文献挖掘及生物信息学数据库下载,统计分析筛选胃癌诊断相关microRNA。(4) 建立茎环逆转录荧光定量PCR方法检测血浆循环microRNA水平。 研究方案(5) 逆转录条件和荧光定量PCR方法的优化。(6) 检测临床样本和健康对照组外周血循环microRNA水平(7) 临床资料和检测数据统计分析,确定胃癌诊断的microRNA组合模式,并提出诊断标准。技术路线胃癌患者文献挖掘公共数据库下载健康对照胃癌差异miRNA胃癌相关miRNA分离血浆/血清总RNA提取备选miRNAmiRNA检测方法的建立和优化循环miRNA水平与临床资料分析胃癌早期诊断及预后的microRNA组合模式材料Tri-Reagent BD试剂购自Sigma公司;miRNA定量PCR芯片检测购自Exiqon公司;miRNA定量PCR检测试剂盒购自Qiagen公司;DEPC水购自宝生物工程(大连)有限公司。结果胃癌患者特征血清miRNA的筛选 miRNA差异倍数(胃癌/正常对照)P值上调hsa-miR-218.7620.009hsa-miR-320a5.2670.005hsa-miR-29a3.9390.014hsa-miR-2102.7380.013hsa-miR-3782.350.01下调hsa-miR-146a0.340.005hsa-miR-181b0.190.017hsa-miR-2030.1330.02hsa-miR-3820.0450.006采用含384条miRNA的定量PCR芯片检测3例Ⅲ-Ⅳ期的胃癌患者血清及3例健康对照血清miRNA的表达水平。结果显示(图1及表2),9条miRNA差异倍数大于2,且P值小于0.01,其中5条miRNA明显上调,4条明显下调。结果胃癌患者特征血清miRNA的验证进一步采用Qiagen公司的定量PCR检测试剂盒,分析100例胃癌患者血清标本及60例健康对照血清中候选miRNA的表达。如图2所示,筛选获得的9条miRNA均得到验证。结果胃癌患者特征血清miRNA的诊断效能评价聚类分析产生的系统树图可见,9个胃癌患者特征血清miRNA能够清晰地将胃癌患者与正常人分为两类。miRNA曲线下的面积P 值95% 置信区间下限上限miR-210.93400.8770.992miR-3200.92700.860.993miR-29a0.98200.9551miR-2100.8700.7810.959miR-3780.86200.7710.953miR-146a1011miR-3821011miR-181b0.90900.8220.996miR-2030.97800.951利用单一miRNA诊断胃癌的ROC曲线分析显示,9条均有较好的诊断效率。进一步利用胃癌患者血清标本及健康对照血清的miRNA表达水平建立 logistic回归模型,采用ROC曲线分析9个胃癌患者特征血清miRNA的诊断效能。结果显示,检测胃癌样本的曲线下面积(AUC)达0.934 (95% CI 0.877-0.992)(P0.001) 技术创新本项目采用定量PCR芯片结合定量PCR筛选、验证血清microRNA表达谱,获得9条胃癌特异相关的血清miRNAs。在分别分析单一miRNA诊断胃癌效率的基础上,综合9条miRNA,提出胃癌早期诊断的特异周血循环microRNA组合模式,为胃癌的诊断提供新的思路。(
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