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数学与生物信息科学交叉研究领域文献分析报告 邵伟文 中国科学院国家科学图书馆 冯雷 中国科学院数学与系统科学研究院 摘要：中科院“创新2020”方案中包括了筹建数学科学交叉应用研究中心这一重要内容，该中心将涉及到“数学与生物信息”这一重要交叉领域，为了对数学与生物信息科学交叉研究领域的发展状况有一个比较清晰的了解，我们从现有文献入手，拟对这方面的SCI收录文献做一个全面的分析整理，试图从国际范围内探索这一领域的发展趋势和前景。 本报告详细分析了数学与生物信息科学交叉研究领域现有文献的状况，包括论文产出的增长趋势、论文被引用情况和增长趋势、论文产出的国家和地区以及科研机构、论文产出涉及到的交叉学科、论文登载的期刊情况，详细列出了这些项目的论文数量排名靠前的名单，另外也分析了中国学者在这一领域的研究情况，最后小结提出一些建设性建议。 一、论文产出数量和增长趋势 从ISI数据库检索到国际上“生物信息科学”领域中被SCI收录的相关文献22454篇，其中与“数学”学科具有交叉的文献3008篇，占这一领域文献量的13.40％，这些文献与数学中各二级类别的交叉分布状况见表一： 表一、数学与生物信息科学领域交叉文献 中文名称 英文名称 篇数 百分比 数学与计算生物学 MATHEMATICAL COMPUTATIONAL BIOLOGY 2380 10.5994 % 数学 MATHEMATICS 24 0.1069 % 应用数学 MATHEMATICS, APPLIED ?287 1.2782 % 数学跨学科应用 MATHEMATICS, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS 118 0.5255 % 运筹学与管理科学 OPERATIONS RESEARCH MANAGEMENT SCIENCE 127 0.5656 % 数学物理 PHYSICS, MATHEMATICAL 47 0.2093 % 统计学与概率论 STATISTICS PROBABILITY 959 4.2710 % 使用ISI分析工具，统计分析数学与生物信息科学交叉领域被SCI收录的3008篇论文的发表年代，可以清晰地看到该领域的论文的产出趋势：从1979至1997年，该领域的文献非常稀少，只是零星的有一些探索，自1998年以来，该领域的文献呈现线性增长趋势，这一阶段到2006之后突然出现一个三年的跳跃式增长，目前仍然在快速增长中（图一）。 图一、数学与生物信息科学交叉领域文献产出数量和趋势 该领域的3008篇文献至今已经被引用25553次，篇均被引8.5次，单篇最高被引685次，引文自二十一世纪以来呈现指数增长的趋势（图二），该领域的文献价值的影响力越来越大，说明这一交叉领域得到了科研人员较大的关注。另外表二列出了该领域被引Top25文献，中国学者有两篇论文进入top25文献。 图二、数学与生物信息科学交叉领域文献引文产出数量和趋势 表二、数学与生物信息科学交叉领域被引Top25文献 序号 文献信息 被引次数 年均被引 1 标题: Using Bayesian networks to analyze expression data 作者: Friedman N, Linial M, Nachman I, et al.会议信息: 4th Annual International Conference on Computational Biology (RECOMB 2000), APR 08-11, 2000 TOKYO, JAPAN来源出版物: JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY?卷: 7?期: 3-4?页: 601-620?出版年: 2000 685 62.27 2 标题: The systems biology markup language (SBML): a medium for representation and exchange of biochemical network models 作者: Hucka M, Finney A, Sauro HM, et al.来源出版物: BIOINFORMATICS?卷: 19?期: 4?页: 524-531?出版年: MAR 1 2003 540 67.50 3 标题: Modeling and simulation of genetic regulatory systems: A literature review 作者: De Jong H来源出版物: JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY?卷: 9?期: 1?页: 67-103?出版年: