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“ ” “ ” UNIPROT数据库应用实例 医学生物化学与分子生物学 2014602619 郭振昌 实例:提取HELA细胞全细胞裂解液中的蛋白,通过质谱分析得到相应肽段,再利用PROTEOME DISCOVERER软件搜索HELA细胞中蛋白的种类 意义:通过比较HELA细胞与正常细胞的蛋白种类,进一步确定细胞癌变后蛋白种类的变化,为研究治疗药物奠定基础 进入UNIPROT页面,搜索所需要的数据库 下载数据库 选取对应的格式进行下载 此为下载完成后的UNIPROT-MOUSE数据库 PD软件界面 添加数据库到软件 点击add进行添加 选择UNIPROT-HUMAN数据库 新建一个搜索 添加要搜索的数据 在设置参数中 选择数据库 打开搜索完成后的文件 得到蛋白得分,双击可查看蛋白序列 稍后对P10809在数据库网页中进行搜索 蛋白序列 蛋白在数据库中对应的序列 对P10809进行数据库中搜索,得到其具体信息 并且我们可以得到其数据库中的序列,可与前面分析得到的数据比较进行评价 从软件分析中我们还可以得知在该数据库中符合该蛋白的肽段 将所得数据导入EXCEL表,方便数据的查询与筛选 谢谢大家! “ ” “ ”

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