生物信息学作业实验2.doc

 PAGE \* MERGEFORMAT 26 广州大学学生实验报告开课学院及实验室：生命科学学院 计机楼401基础1 2013年 11 月 8 日 学 院生命科学学院年级、专业、班生物工程10姓名学号10实验课程名称生物信息学　成绩　实验项目名称　实验二 核酸序列的检索指 导 教 师　 一、实验目的 1、掌握核酸序列检索的操作方法； 2、熟悉GenBank数据库序列格式及其主要字段的含义； 3、了解EMBL数据库序列格式及其主要字段的含义； 4、熟悉GenBank数据库序列格式的FASTA序列格式显示与保存； 二、实验内容 1、在GenBank数据库中查询核酸序列NM_000230、下载（以两种格式保存：GenBank与Fasta）、写出GenBank格式主要字段含义。 2、在EMBL数据库中查询核酸序列BC060830、下载（以两种格式保存：complete entries与Fasta）、写出complete entries格式主要字段含义。 三、实验步骤 3.1、GenBank数据库中查询核酸序列NM_000230 3.1.1 GenBank格式及主要字段含义 LOCUS（序列名称） NM_000230 3444 bp mRNA linear PRI 03-NOV-2013 DEFINITION（序列的简单说明） Homo sapiens leptin (LEP), mRNA. ACCESSION（序列编号） NM_000230 VERSION（序列版本号） NM_000230.2 GI:169790920 KEYWORDS（与序列相关的关键词）RefSeq. SOURCE（序列来源的物种名） Homo sapiens (human) ORGANISM（序列来源的物种 Homo sapiens 学名和分类学位置） Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini; Catarrhini; Hominidae; Homo. REFERENCE（相关文献编号与递交序列的注册信息） 1 (bases 1 to 3444) AUTHORS（相关文献的作者或递交序列的作者） Lee,J.H., Zhou,L., Kwon,K.S., Lee,D., Park,B.H. and Kim,J.R. TITLE（相关文献题目） Role of leptin in Legg-Calve-Perthes disease JOURNAL（相关文献刊物杂志名或递交序列的作者单位） J. Orthop. Res. 31 (10), 1605-1610 (2013) PUBMED（PUBMED中文献的编号） REMARK（相关文献注释） GeneRIF: Leptin might play an important role in Legg-Calve-Perthes disease pathogenesis. REFERENCE 2 (bases 1 to 3444) AUTHORS Fourati,M., Mnif,M., Kharrat,N., Charfi,N., Kammoun,M., Fendri,N., Sessi,S., Abid,M., Rebai,A. and Fakhfakh,F. TITLE（相关文献题目） Association between Leptin gene polymorphisms and plasma leptin level in three consanguineous families with obesity JOURNAL Gene 527 (1), 75-81 (2013)