基于D-LOOP基因的中国沿海鳓鱼种群遗传结构研究基于D-LOOP基因的中国沿海鳓鱼种群遗传结构研究.pdf

第 40 卷 第 3 期 海 洋 与 湖 沼 Vol.40, No.3 2009 年 5 月 OCEANOLOGIA ET LIMNOLOGIA SINICA May, 2009 基于 D-LOOP 基因的中国沿海鳓鱼(Ilisha elongata) 种群遗传结构研究* 吴常文 许逸天 吕振明 张建设 (浙江海洋学院 舟山 316004) 提要 采用线粒体控制区基因序列测定技术, 分析了我国沿海重要经济鱼类鳓鱼 4 个地理群体的 遗传结构及其变异。结果表明, 我国的鳓鱼资源经过度捕捞后仍保持着丰富的遗传多样性, 在检测的 45 个鳓鱼个体中共得到 44 个单倍型, 单倍型多样性指数(H)高达 0.964—1.000, 平均核苷酸多样性指 数(Pi)高达 0.0100—0.0152, 鳓鱼种群的多样性还表现在线粒体控制区的序列长短上, 研究表明, 鳓 鱼线粒体控制区存在一个 40bp 长度的重复序列, 依据重复次数的多寡而造成鳓鱼个体间的显著差异; 对鳓鱼群体的遗传结构进行检测发现, 我国鳓鱼群体内部存在明显的遗传分化, 青岛群体与广州、厦 门、舟山 3 个群体之间分化系数 Fst 达 0.5284(P0.01), 群体间基因流则仅有 0.4463, 而 3 个群体内 部则基因流明显; AMOVA 检测和聚类分析也证实了上述观点, 遗传距离分析表明青岛群体和其它 3 个群体净遗传距离达到 0.034, 仍属于种内群体之间的分化水平, 依据分子钟理论推断两群体间的分 化时间为更新世晚期, 可能由更新世晚期海平面的反复升降导致了这两个类群的隔离与分化, 并依 靠鳓鱼本身的生物学特性维持至今。 关键词 鳓鱼, D-LOOP 基因, 遗传变异 中图分类号 Q953 对鱼类种群遗传结构的研究和了解是当前渔业 海洋鱼类资源进行有效的开发和管理, 许多学者对 资源管理的重要组成部分(Tudela et al, 1999)。对种群 黄渤海、东海和南海的鱼类种群结构和遗传变异进行 遗传结构的研究不仅可以为鱼类资源的种群识别 了广泛的研究(蒙子宁等, 2003; 王伟继等, 2000; 韩 (Amaral et al, 2007; Beheregaray et al, 2001)、谱系发 志强等, 2006; Shang et al, 2008, 为我国鱼类资源的 生(王成辉等, 2004)、扩散规律(Lintas et al, 1998)、适 健康和持续发展作出了重要贡献, 但迄今为止, 在同 应性判定(Frankham, 1995)提供基本信息, 同时也为 样是重要经济鱼类的鲱科鱼类上, 类似的研究相对 鱼类资源的保护、种群恢复等人工措施提供理论基础 较少。 (Han et al, 2008a, b)。近年来, 随着国际社会对近岸和 鳓 Ilisha elongata 是我国沿海一种重要的鲱科鱼 海洋鱼类资源开发和管理的不断深入, 鱼类种群结 类, 又名曹白鱼、鲞鱼,