油松雌雄球花高通量基因表达谱芯片分析.pdfVIP

第49卷 第 9期 2 0 1 3年 9月 林 业 科 学 SCIENTIA SILVAE SINICAE Vo1．49．No．9 Sep．，2 0 1 3 doi：10．11707／j．1001-7488 油松雌雄球花高通量基因表达谱芯片分析 钮世辉 (1．北京林业大学生物科学与技术学院 袁虎威 陈晓阳 林木育种国家工程实验室 北京 100083； 木 李 伟 2．华南农业 大学林学院 广州 510642) 摘 要： 生殖调控是针叶树种遗传改良与良种生产过程中的重要环节，已经有许多实践经验积累，然而对其中雌 雄球花发育及调控的分子生物学基础研究仍相当匮乏。以油松多个体多组织样本均一化 cDNA文库为材料，通过 转录组测序，获得 46 584个油松单基因簇；基于这些基因信息，设计并定制油松表达谱芯片；通过对雌雄球花基因 表达芯片分析，筛选到 2 460个在球花发育后期显著差异表达的基因，其中1 309个在雄球花优势表达，1 151个在 雌球花优势表达。分别从雄球花与雌球花优势表达的基因中各挑选 1个表达水平差异超过 800倍的基因，由于其 功能未知，分别命名为MCE1(Male Cone Expressed 1)与 FCE1(Female Cone Expressed 1)，并进一步分析它们在雌雄 球花不同发育阶段的表达规律。结果表明：MCE1只在雄球花各发育阶段高水平表达，而在雌球花各发育阶段表达 水平极低，推测其参与雄球花的整个发育过程；FCE1在早期雄球花中大量表达，但随着雄球花的发育其表达量会 急剧降低，而在雌球花中却始终稳定地高水平表达，推测其在雌雄球花不同发育阶段发挥不同的作用。研究结果 可为油松及近缘树种雌雄球花发育的分子生物学研究提供基础和新的思路。 关键词： 油松；转录组测序 ；基因芯片；雌球花；雄球花 中图分类号：$718．46；Q943．2 文献标识码：A 文章编号：100l一7488(2013)09—0046—06 M icroarray Analysis of Large Scale Gene Expression Profiles between Male and Female Cones of Pinus tabulaeformis Niu Shihui Yuan Huwei Chen Xiaoyang 。 Li W ei (1．National Engineering Laboratory for Tree Breeding Col e of Biological Sciences and Biotechnology，Belting Forestry University Beijing 100083；2．Colege of Forestry，South China Agricultural University Guangzhou 510642) Abstract： Reproductive control is an important part of the conifer genetic improvement and seed production process，on which there are a lot of practical experience accumulation． However，the relevant study in molecular biology on the development and regulation of conifers male and female cones is still very scarce．The Pinus tabulaeformis transcriptome of a normalized cDNA library from multiple tissues and individuals was sequenced，and a total of 46 584 unigenes were found．Based on the information of these genes，microarrays of P．tabulaeformis were designed．Through the microarray analysis of large scale gene expression profiles between male and female cones at the later stage of development。2 460 diferentialy expressed genes were obtained．of which 1 309 are