DNA条形码技术在生物分类中的应用的论文.docVIP

　　DNA条形码技术在生物分类中的应用的论文 作者：韦健红,吴文如,喻良文,林小桦,李薇 【摘要】 dna条形码技术是通过使用dna序列对物种进行快速、准确识别的技术。目前在动物分类中最常使用的基因序列是线粒体细胞色素c氧化酶ⅰ亚基(mtcoⅰ)。该技术的出现可以为研究物种的进化 规律 、遗传变异、系统发育以及生物多样性等提供理论依据。为了让更多非生物分类学研究者了解并将其应用于更多的领域，本文概述了dna条形码技术的工作流程、技术特点以及在生物分类中的应用和对未来的展望。 【关键词】 dna条形码;生物分类;线粒体coⅰ基因;物种鉴定;应用分析 　)abstract: dna barcoding is a taxonomic method that uses a short geic marker in an organism′s dna to identify it as belonging to a particular species. currently,it has been y itochondrial cytochrome c oxidase subunit ⅰ (mtcoⅰ). it could provide a theoretical basis for studying the lay to learn more and apply the technology in more fields. 　　key y; mitochondrial coⅰ gene; species identification;application analysis 　　继2002年tautz等[1]提出要用dna序列作为生物分类系统的主要平台，即dna分类学后，加拿大guelph大学的动物学家paul hebert[2,3]在2003年就明确提出了dna条形码(dna barcoding)的概念。.dna条形码技术简单地说，就是通过使用一个或一些短的 dna基因片段作为条形码来对物种进行快速、准确识别的技术。由于该技术具有利用生物种群中的某些遗传保守性很强的dna片段进行物种鉴定和亲缘关系的定位，了解其分支来源，甚至可以预知其进化方向等诸多用途，使其成为近年来生物分类学家关注的热点。为了让更多非生物分类学研究者熟悉并将其应用于更多的领域，本文概述了dna条形码技术的主要工作流程、技术特点、在生物分类研究中的应用及争论焦点，并展望了该技术的应用前景。 　 　1 dna条形码技术主要工作流程 　　dna条形码技术所应用的分子生物学技术并不复杂，主要工作流程包括样品采集、dna提取、设计和合成通用引物、选引物，优化反应条件进行pcr扩增、pcr产物的纯化、序列测定和分析。简单来说，即通过对一组来自不同生物个体的短的同源dna序列(约800 bp )进行pcr扩增和测序，随后对测得的序列进行多重序列比对和聚类分析，从而将某个体精确定位到某个分类群中。 　　序列数据分析是dna条形码探索的最重要环节，首先进行序列比对和人工校正，通过mega 或paup 计算 种内和种间的k2p距离(kimura2parameter distance ) [4]用于表示不同分类阶元之间的序列变异程度，比较种、属和科 3 个水平上的序列差异， 然后根据计算结果建立nj 树(neighbourjoining tree)，最后依据dna条形码遗传距离就能对未知标本进行分类和鉴定。 　　 2 dna条形码的技术特点 　　dna条形码技术提供了信息化的分类学标准和有效的生物分类学手段，成为进展最迅速的学科前沿之一。目前它主要应用于生物信息学和分类学领域，该技术具有以下几个特点。 　　(1)不受发育阶段的影响。同种生物的dna序列信息在不同的生命周期是相同的，所以该技术检测对象可以是生物生命过程中的每一时期，如虫卵、幼虫、成虫、植物生长的任意生长阶段等，较之传统的方法扩大了研究对象的范围并有利于标准化的实现。 　　(2)不受个体形态特征的影响。传统分类对各种形态特征齐全的标本的依赖，对于被子植物来说，根据缺少花果的标本，很难正确鉴定。应用dna条形码技术分类即使当样本受损也不会影响识别结果，而且还能准确地辨别形态相似性很高的物种。 　　(3)不受物种的限制。一个标准dna条形码数据库一但建立，可使各种物种的鉴定成为可能，不限于濒危物种、土著物种或入侵种等。 　　(4)可以鉴定出许多群体中普遍存在的隐存分类单元。 　　(5)获取信息量大。可通过建立dna条形码数据库，一次快速鉴定大量样本。 　　(6)精确性高。dna条形码技术利用碱基actg组成的序列使物种鉴别数字化。这种数据库使得全球范围内的现生物种能够很准确的鉴定出