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藻门中的系统进化地位
第 40 卷 第 6 期 海 洋 与 湖 沼 Vol.40, No.6
2009 年 11 月 OCEANOLOGIA ET LIMNOLOGIA SINICA Nov., 2009
运用 nrDNA ITS 数据研究角叉菜属(Chondrus)在红
藻门中的系统进化地位*
胡自民1 Alan T. Critchley2 段德麟1①
(1. 中国科学院海洋研究所 青岛 266071; 2. Acadian Seaplants Limited, 30 Brown Ave Dartmouth B3B 1X8, Canada)
提要 测定了角叉菜属(Chondrus)5 个代表种的核糖体 DNA 内转录间隔区(ITS)及 5.8S rDNA 基因
序列。结果表明, 角叉菜属 ITS 区(含 ITS1、5.8S rDNA 和 ITS2)序列长度范围为 704—714bp, G+C
含量为 44.6%—45.7%, 变异位点 69 个, 信息位点 16 个; 其中, ITS1 和 ITS2 的长度范围分别为
147—149bp 和 398—404bp。5.8S rDNA 长度为 158bp, 没有变异和信息位点。由 MEGA3 构建的系
统进化树(ME 和 MP)显示：在进化尺度上, 真红藻纲的松节藻科(Rhodomelaceae)与红毛菜纲
(Bangiophyceae)亲缘关系较近。在真红藻纲内, 杉藻目(Gigartinales)的进化地位相对较高, 其次是海
膜科(Halymeniaceae)、石花菜科(Gelidiaceae)、红叶藻科(Delesseriaceae)和粉枝藻科(Liagoraceae)等,
而松节藻科进化地位相对较低。在杉藻目内, 杉藻科(Gigartinaceae)和胶黏藻科(Dumontiaceae)进化关
系密切, 而形态学特征相似的角叉菜和马泽藻(Mazzaella)亲缘关系非常近。
关键词 角叉菜, 红藻, 系统进化, nrDNA ITS, 支系发育
中图分类号 Q949.29
角叉菜(Chondrus Stackhouse)在分类学上隶属于 核糖体 DNA 是编码核糖体 RNA 的基因, 在植物
红藻门(Rhodophyta)、真红藻纲(Florideophyceae)、杉 细胞核中以重复连续排列的方式存在, 其在每个细
藻目(Gigartinales)、杉藻科(Gigartinaceae)。该属目前 胞中的拷贝数目在 1000—10000 之间。由于核糖体
在全球范围内报道有 9 种, 主要分布于寒温带海域, DNA 中包含了进化速率不等的编码区、非编码转录
其中北太平洋 7 种, 北大西洋 1 种, 南太平洋 1 种(苏 区和非转录区, 因而可以选取其中保守程度不同的
乔等, 2002)。角叉菜是重要的经济海藻, 藻体中含有 片段用于不同类属的系统发育和进化研究(Baldwin
大量的卡拉胶(达干重的 80%), 因此是制备卡拉胶的 et al, 1995)。ITS(Internal transcribed spacer)是核糖体
主要原料, 同时也是食品和纺织工业的重要原料(曾 DNA 中介于 18S 和 5.8S 之间(ITS1)以及 5.8S 和 26S
呈奎等, 1962)。目前, 国内对角叉菜的研究主要集中 之间(ITS2)的非编码转录间隔区。由于 I
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