基因芯片技术在常见肠道致病菌感染检测中的应用.pdfVIP

山东医药 2013 年第 53 卷第 4 期 基因芯片技术在常见肠道致病菌 感染检测中的应用 戈海泽 l ，梁慧敏 2 ，卢晋英 1 ，刘树业 1 (1天津市第二中心医院，天津 300170;2 天津医科大学) 摘要:目的 建立一种运用 PCR 结合基因芯片技术检测和鉴定引起腹泻的常见肠道致病菌方法。方法 根据 生物信息学技术以细菌 16S rDNA 和 23S rDNA 序列设计各细菌的特异型探针和引物，在基因芯片制备基础上，通 过对靶基因的扩增、杂交和对杂交结果的分析，对常见肠道致病菌的检测和鉴定效果进行评价，同时对临床采集 l ∞份腹泻患者粪便标本通过细菌培养结果，比较基因芯片技术的灵敏性和特异性。结果 l ∞份临床粪便标本 中，采用基因芯片技术共检出 50 份 (50% )携带肠道致病菌;细菌培养鉴定出 47 份 (47% )携带肠道致病菌，其中 42 份基因芯片与细菌培养结果一致，准确率为 79.25 3毛，与基因芯片比较差异无统计学意义(矿 =5.28 ， P0.05) 。结 论 我们所建立的基因芯片系统具有高通量和高准确性，可以作为临床鉴定细菌的一个重要的工具，而且适用于 流行病学调查研究。 关键词:基因芯片;肠道致病菌;细菌培养;高通量 doi: 10. 3969/j. issn. loo2-266X. 2013. 04. 08 中图分类号:R5 12.5 文献标志码 :A 文、章编号: 1 ∞2-266X( 2013 )04-0024-04 Detection of Common Intestinal Pathogens Infection with Gene Chip Technology GE Hai-ze 1 , LIANG Hui-min , LU Jin-ying , L/U Shu-ye (1 Tiα叩iin Third Central Hospital , Tiα乓;in 3∞ 170 ， P. R. Chinα) Abstract: Objective To establish a PCR-Gene chip technology for detecting common intestinal pathogens that causes the diarrhea and provide the theory instruction to the intestinal tract inflammation. Meth叫s Biotin-Iabeled universal primers for amplification of bacterial 16S rDNA and 23S rDNA were used to amplify extracted genome DNA. Appraising the detect and authenticate effect through expanding the target gene , the hybrid and the hybrid result analysis , meanwhile 100 fecal samples from patients wìth diarrhea were detected and identified using this assay and bacilliculture results , to inspect the sensitivity and specificity of gene chip technology. Results Among 1 ∞ fecal samples