真核生物内含子研究进展.docVIP

Bioprocess生物过程, 2011, 1, 9-12 /10.12677/bp.2011.12003 Published Online December 2011 (/journal/bp/) Research Progress in Eukaryotic Intron* Jun Cao Institute of Life Science, Jiangsu University, Zhenjiang Email: cjinfor@163.com Received: Sep. 9th, 2011; revised: Oct. 6th, 2011; accepted: Oct. 28th, 2011. Abstract: Intron is the genome sequence that is cut out in mature RNA transcripts. Full sequencing of a number of eukaryotic genome gives us some help to understand the intron evolution, exon-intron organization etc. This paper reviewed some progress in intron distrubtion, intron generated hypothesis, spliceosome and major splice sites, intron acquisition and lose and its mechanisms, factors affecting the evolution of intron, and so on. Keywords: Intron; Evolution; Intron Acquisition and Lose 真核生物内含子研究进展* 曹 军 江苏大学生命科学研究院，镇江 Email: cjinfor@163.com 收稿日期：2011年 9月 9日；修回日期：2011年 10月 6日；录用日期：2011年 10月 28日 摘 要：内含子是成熟 RNA转录本中被剪切掉的基因组序列。一些真核基因组测序的完成有助于了解 内含子进化问题，如真核基因外显子/内含子的结构等等。本文就内含子分布、内含子产生假说、拼接 体及主要拼接位点、内含子获得和丢失及其机制、影响因素等方面做简要综述。 关键词：内含子；进化；内含子获得与丢失 1.引言 剪接功能，不需要剪接体和 snRNA的参与，也不需 要 ATP功能；最为常见的是 III类内含子，又叫拼接 体内含子，存在于绝大多数真核细胞 mRNA前体中； 另外一种是 IV类内含子，存在于核 tRNA前体中， 又称核 tRNA前体内含子，它是 tRNA的基因及其转 录产物中的内含子。本文主要针对拼接体内含子研究 现状做简要综述。 内含子是基因内间隔的一段序列，它不出现在成 熟的 RNA分子中，在转录后通常被加工去除。自上 世纪七十年代内含子被发现以来，这种独特的结构元 件一直备受人们关注。内含子存在于已知所有类型生 物中，根据内含子存在宿主的不同，可以把内含子分 为：mRNA内含子、rRNA内含子、snoRNA内含子 及 snRNA内含子等。根据内含子剪接机制的不同， 又可把内含子以下四类： I类内含子、II类内含子、 III类内含子和 IV类内含子。其中， I类内含子存在 于叶绿体、线粒体、某些低等真核生物的 rRNA基因 及原核生物的噬菌体中；II类内含子主要存在于细胞 器(如线粒体)及细菌中，它的剪接位点类似于 III类 内含子，并同样遵从 GT|AG规律，但 II类内含子不 同于 III类内含子主要表现在： II类内含子具有自我 2.拼接体内含子特点及其基因组分布 拼接体内含子仅存在于真核生物核基因组中，其长 度往往与所处物种有关，如线虫、昆虫中内含子长度有 的仅几十个碱基，而哺乳动物中有的却高达几百万以上。 根据内含子插入密码子位置的不同又可把拼接体 内含子分为三类：内含子插入在两密码子之间的为 0 相内含子；插入在密码子第一个碱基之后的为 1相内 含子；插入在密码子第二个碱基之后的为 2相内含子。 研究表明：在所有已知基因组中，0相内含子所占比 例最大。内含子数目与基因组复杂性有关，一般认为： * 资助信息：江苏省自然科学基金(BK2011467)，江苏大学高级人才 启动基金(10JDG027)。 Copyright ? 2011 Hanspub Bp  10 曹军 |真核生物内含子研究进展 [5] 越