Canine Genomics and Genetics Running with the Pack 英文参考文献.docVIP

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2017-05-11 发布于上海
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Canine Genomics and Genetics Running with the Pack 英文参考文献.doc

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Canine Genomics and Genetics Running with the Pack 英文参考文献

Review CanineGenomicsandGenetics:Running withthePack Heidi G.Parker, Elaine A.Ostrander* ABSTRACT likelihoodpredictionstobe27morgansingeneticdistance [8].Estimatesbasedon?owsortingofchromosomessuggesta physicalsizeof2.8gigabases[9,10].Predictionsbasedon sequenceanalysisofeuchromaticsequencesuggestasizeof 2.3–2.4gigabases[1,11].Integratedlinkage,radiationhybrid (RH),andcytogeneticmapsofthedoggenomecon?rmed thesegeneralconclusions[12–15]. T hedomesticationofthedogfromitswolfancestorsis perhapsthemostcomplexgeneticexperimentin history,andcertainlythemostextensive.Beginning withthewolf,manhascreateddogbreedsthatarehuntersor herders,bigorsmall,leanorsquat,andindependentorloyal. Mostbreedswereestablishedinthe1800sbydogfanciers, usingasmallnumberoffoundersthatfeaturedtraitsof particularinterest.Popularsireeffects,population MostrecentlyacomparativeRHmapofthedoggenome containing10,000caninegenesequenceshasproven invaluableforidentifyingsmallrearrangementswithinthe caninegenome(http://www-recomgen.univ-rennes1.fr/doggy. html)[16],aswellasassistingintheorderingofcontigsforthe draftassembly[1].Thegenesequencesusedinconstructionof the10,000-geneRHmapwerederivedfroma1.53sequenceof thestandardpoodle.Thisinitialsequenceofthedoggenome containedatleastpartialorthologsfor75%(18,473)of annotatedhumangenes[11].Portionsof9,850individualgenes orabouthalfofalldoggeneswerelocalizedonanRHpanel with200kilobaseresolution[16].Atotalof264conserved segmentslessthan500kilobasesinsizewereidenti?edfroma comparisonofthedogmapandhumangenomesequence (NationalCenterforBiotechnologyInformationBuild34), matchingwellwithpredictionsfromthedraftassembly[1]. Thisprovidedaclearsnapshotoftheorderofcaninegenes relativetothehumangenome,andpreciseinformationabout breakpointposition.Subsequentstudiesonbreakpointreuse acrossmammaliansystems,utilizingRHmapsfromavarietyof mammalianspecies,verifythesedata[17]. bottlenecks,andstrictbreedingprogramsdesignedtoexpand populationswithdesirabletraitsledtothedevelopmentof w