湖北钉螺多态微卫星DNA位点筛选和特征初步分析.pdfVIP

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湖北钉螺多态微卫星DNA位点筛选和特征初步分析.pdf

• 122. 中国血吸虫病防治杂志 2010 年第22 卷第2 期 Chin J Schisto Control 2010 , Vol.刀,胁.2 ·论著· [文章编号] 1则-6661 (2010)02-0122心4 湖北钉螺多态微卫星DNA 位点筛选和特征初步分析 学石柱1 ,正艺秀1 气马雅卒3 ,王强1 ,刘琴l ,吴攒1 ,吕山1 ,张仪1 ,周晓农1. [摘要] 目的 分离湖北钉螺的微卫星DNA 序列,筛选多态的微卫息 DNA 位点并分析其特征。方法应用湖北钉螺基 因组 DNA 的酶切片段与生物素标记的(AAT) 17 、 (GA)25 、( CCT) 17 、 (CA)25等 10 个寡核背酸探针杂交,富集、浓缩、克隆并 测序,构建微卫星 DNA 库。挑选合适的微卫星 DNA 位点设计并合成号|物,扩增钉蝶样本经聚丙烯酌胶凝胶电泳筛选多 1å5性。结果 获得湖北钉螺做卫星 DNA 序列 205 条,GenBank 注册登记号 GU2倒例4-GU却4248 ,其中完整重复序列 74 条,占 36.10% ;非完粮3重复序列 102 条,占49.769岛;集合重复序列29 条,占 14.15% 0 设计合成的20 对微卫星DNA 位点 号|物中,任蝶~撮示 13 个位点具有多态性。结论 分离建立了湖北钉螺微卫厦DNA 序列库,为湖北钉螺群体遗传、种群 溯源等相关研究提供了分子标志。 [~键词] 湖北钉螺;微卫星 DNA; 多态性 [中回分类号] R383.24 [文献标识饲] A Isolation and characterization of polymorphic microsatellite markers of On- comelania hupensis 1 1 2 3 1 1 1 1 μ Shi-zhu , Wang Yi_xiu • , Ma 1,町un , Wang Qiang , li.u Qin: , Wu Yingl , Lv Shan , Z阳ng Yi , Zhou Xiao-nong • 1 Natωnal Instit uJ.e of Para.sitic Diseωes , Chinese Centerfor Disea.se Control and Pr,附ntion , Shanghai 200025. China; 2 l拚 Sci­ ence College , Shaanxi Nomωl Unit服rsity , Chi础; 3 Department (扩 Etωlogic Biology , Second Milit,αry Medical Univers时• China *Correspond仇.g aωhor [Abstract] 圳ective To isolate the microsatellite DNA sequences of Onco脚印nia hupensis and analyze the polym呐ic mic- rosatellite loci. Me伽耐s ηle digested genomic fr:哺nents were hybridized with biotinylated oligonucleotide probes. The target fragmenωmoleculars were captured and enriched. Then these fr,咱nents were cloned and sequenced. 响le suitahle micro自atellite loci were ch制en and the polymorphism wωscreened by PAGE gel ele心trophoresis. ResuJts Aωtal of 205 mic酬atell

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