Prediction of genetic gain from quadratic optimisation with constrained rates of inbreeding 英文参考文献.docVIP

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2017-05-12 发布于上海
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Prediction of genetic gain from quadratic optimisation with constrained rates of inbreeding 英文参考文献

Genet.Sel.Evol.38(2006)127–146 c INRA,EDPSciences,2006 DOI:10.1051/gse:2005032 127 Originalarticle Predictionofgeneticgainfromquadratic optimisationwithconstrainedrates ofinbreeding BeatrizVillanuevaa?,SantiagoAvendano? a, JohnA.Woolliams b a ScottishAgriculturalCollege,WestMainsRoad,Edinburgh,EH93JG,Scotland,UK b RoslinInstitute(Edinburgh),Roslin,Midlothian,EH259PS,UK (Received11April2005;accepted7October2005) Abstract–Thereareselectionmethodsavailablethatallowtheoptimisationofgeneticcontri- butionsofselectioncandidatesformaximisingtherateofgeneticgainwhilerestrictingtherate ofinbreeding.Thesemethodsimplyselectiononquadraticindicesastheselectionmeritofa particularindividualisaquadraticfunctionofitsestimatedbreedingvalue.Thisstudyprovides deterministicpredictionsofgeneticgainfromselectiononquadraticindicesforagivensetof resources(thenumberofcandidates),heritability,andtargetrateofinbreeding.Therateofgain wasobtainedasafunctionoftheaccuracyoftheMendeliansamplingtermatthetimeofcon- vergenceoflong-termcontributionsofselectedcandidatesandthetheoreticalidealrateofgain foragivenrateofinbreedingafteranexactallocationoflong-termcontributionstoMendelian samplingterms.Theexpectedbene?tsfromquadraticindicesovertraditionallinearindices(i.e. truncationselection),bothusingBLUPbreedingvalues,werequanti?ed.Theresultsclearlyin- dicatehighergainsfromquadraticoptimisationthanfromtruncationselection.Withconstant rateofinbreedingandnumberofcandidates,thebene?tsweregenerallylargestforintermedi- ateheritabilitiesbutevidentovertheentirerange.Theadvantageofquadraticindiceswasnot highlysensitivetotherateofinbreedingfortheconstraintsconsidered. predictionofgeneticgain/quadraticindices/controlofinbreeding/geneticcontributions 1. INTRODUCTION Quadraticoptimisation[7,8,10,11]providesasolutiontotheproblemofop- timisingselectiondecisionsinbreedingschemesformaximisinggeneticgain (ΔG)withconstrained ratesofinbreeding (ΔF).Theselectionmeritofindi- vidualcandidatesisaquadraticfunctionoftheirest