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蛋白纯化培训总结
蛋白纯化培训总结
蛋白质分离纯化一般需经过细胞破碎、澄清、分离等步骤。
1 细胞破碎
常见的细胞破碎方法有超声破碎法、反复冻融法、高压匀浆法、珠磨破碎法等。实验中应根据实验室现有实验条件来选择合适的破碎方法。冻融法操作十分简便,无需特殊设备,在实验室中使用很方便,但耗时,耗能,大规模应用困难。珠磨破碎法适用范围较广,但对操作者的经验水平要求较高,且制备量不易放大。本实验室主要采用高压匀浆法破碎细胞,一方面可以得到充分破碎的细胞,高压匀浆机的制冷系统也可减少蛋白质的热变性的可能,另一方面此种方法与其他方法相比,可在增大细胞破碎量的时候有效的节约时间。若不具备高压匀浆破碎细胞的条件,也可采用超声破碎法,但超声破碎的效率受到声频、声能、处理时间、细胞浓度及菌种类型等多种因素的影响。
2 澄清
经过细胞破碎的蛋白样品中含有大量的细胞碎片,不利于此后纯化过程的进行,需对样品液进行澄清处理。这一过程可通过离心、过滤、微滤等方法进行。实验室较多采用离心的方法获取澄清的液体,也可使用微滤的方法,如使用膜孔大小低于0.45μm的滤膜进行过滤,但容易出现频繁的滤膜堵塞的状况,需多次更换滤膜。大规模生产中可使用过滤的方法,如板框过滤法。
3 分离
分离的方法主要有沉淀法、超速离心、超滤、层析。沉淀法在血液制品的生产中应用较多,如沿用至今的冷乙醇沉淀法制备血浆蛋白。超速离心法根据不同大分子物质沉降系数的不同,通过离心将其分离开来,如用于病毒颗粒的分离。超滤法分离效率不高,主要应用于样品的浓缩。层析法在蛋白纯化中应用最为广泛,主要包含了离子交换层析、反相层析、疏水相互作用层析、亲和层析、体积排阻层析。
3.1 层析
在以上几种层析方法中,应用较多的为离子交换层析和亲和层析。
离子交换层析根据蛋白质与介质之间静电吸附的强弱进行分离。实验中应用离子交换层析时,需要根据纯化对象的不同,在离子交换层析介质、洗脱液pH值、缓冲溶液类型、洗脱盐类型这几方面进行预实验,以寻找出最适的条件,预实验可用重力柱进行。
离子交换层析分为阳离子交换层析和阴离子交换层析,两种类型离子交换剂的常用电荷基团如下表:
阴离子交换剂 阳离子交换剂 Diethylaminoethyl(DEAE)
二乙氨乙基 -CH2CH2N+(CH2CH3)2 Carboxymethyl (CM)
羧甲基
-CH2COO– Quaternary aminoethyl(QAE)
季铵基乙基-CH2CH2N+(C2H5)2CH2CHOHCH3 Sulphopropyl (SP)
-CH2CH2CH2SO3– Quaternary ammonium (Q)
季铵盐-CH2N+ (CH3)3 Methylsulphonate (S)
-CH2SO3– 亲和层析则是通过生物特异性差异分离样品的液相层析技术。可分离其他层析方法难以分离的样品。此种方法需根据纯化的物质不同选择不同的配基。在我们的实验中,选择了将目的蛋白与组氨酸标签融合表达,运用组氨酸标签与层析柱上金属离子(Cu2+、Ni2+、Zn2+、Co2+)的特异结合,来分离纯化目的蛋白。
层析技术的基本步骤包含平衡、上样、洗脱,需根据纯化对象的不同,来探索优化洗脱方案。线性梯度洗脱虽为标准方法,且精确度高,但阶梯洗脱方法往往有更好的效果,实验中需摸索不同洗脱浓度下的洗脱体积,以确定针对特定蛋白样品的最佳方案。如果单一一种层析方法的纯化效果不佳,可尝试采用多种层析方法进行纯化。
实验内容
实验培训中纯化的目标蛋白为在BL21(DE3)菌株中表达的带His标签的可溶融合蛋白,蛋白由IPTG诱导表达,通过超声破碎法裂解细菌得到粗蛋白,在通过亲和层析、蛋白酶切、离子交换层析技术获得纯度达90%以上的目标蛋白。
实验材料:
1.仪器:
高速冷冻离心机、恒流泵、蛋白核酸检测仪(见图1)、电泳仪、pH计
图1
2.层析柱:
IMAC预装柱、Q预装柱、SP预装柱
3.试剂:
Tris、NaCl、Imidazole、Ni2SO4、EDTA、NaOH、重组肠激酶Enterokinase
实验方法:
诱导表达
加入量为:1ml菌液加入1μl 0.5mIPTG,37℃诱导3h.
破菌
破菌buffer:20mM Tris 250mM NaCl 10mM Imidazole,pH 8.0
20:1(ml/g)比例用破菌buffer重悬菌体,Φ10探头400W超声4s,停止6s,循环99次。中间暂停一次搅拌均匀。破菌液12000rpm离心20min。
亲和层析:
Column:IMAN预装柱(规格1ml)
Buffer A:20mM Tris 250mM NaCl 10mM Imidazole,pH 8.0
Buffer B:20mM Tris 250mM Na
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