基于统计特征的酶蛋白质中特殊模体βαβ的预测.pdfVIP

生物物理学报 2013年9月 第29卷 第 9期：658—668 、^～l^^，．cjb．org．ca ACTA BIOPHYSICA SINICA Vo1．29 No．9Sep．2013：658—668 基于统计特征的酶蛋白质中 特殊模体 p0B【的预测 宋航宇， 胡秀珍， 冯振兴， 姜 卓， 孙利霞 内蒙古工业大学理学院，呼和浩特 010051 本文通过 “绿色通道 ”投稿 f推荐编委 ：肖奕) 收稿 日期：2013．09．02；接受 日期：2013．09．10 基金项目：国家 自然科学基金项 目30960090) 通讯作者：胡秀珍，电话：(0471)6576281，E—mail：laxz@imut．edu．ca 摘要：酶类是蛋 白质中的重要组成部分，对其结构和功能的研究有重要的生物学意义。因此 ，作 者对酶类蛋白质 中的复杂超二级结构p0lp模体进行 了统计分析和预测。建立了包含 1141个酶蛋 白质的13~13模体数据库，通过统计分析，确定 以loop-仪一loop长 10~26个氨基酸 的p仪B模体为 研究对象，以离散增量值、残基间的相互作用信息、预测的二级结构信息和矩阵打分值为特征 参数，使用随机森林算法对p仅p模体进行预测，5交