sectionone小分子化合物与DNA的作用.pptVIP

* * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 5. Effect of the steric constrain 当配合物的插入配体的空间位阻增 大时,配合物与CT-DNA的结合反而减弱. 空间位阻 DMTATP dptatp TATP Kb ([Ru(bpy)2TATP]2+ Kb ([Ru(bpy)2 dptatp]2+ Kb ([Ru(bpy)2 DMTATP]2+ 同样,当辅助配体的空间位阻增大时, 配合物与CT-DNA的结合反而减弱.例如 Kb ([Ru(phen)2PIP]2+ Kb ([Ru(dmb)2 PIP]2+ Kb ([Ru(dmp)2 PIP]2+ 6. Effect of the hydropobicity of the ancillary 通常情况下, 增加辅助配体的疏水性会使得配合物同DNA的结合能力增强.例如phen的疏水性比bpy的要强,因此当主配体时,以phen为辅助配体的配合物同DNA的结合力比以bpy为辅助配体的配合物同DNA的结合力要强. * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * （1）光谱学方法 吸收光谱和发射光谱对环境比较敏感，易于测试，因此常用来检测化合物与DNA的相互作用。通常配合物与DNA结合后会导致其配体所处的微环境发生改变，结合的强弱可通过电子吸收光谱、发射光谱等一系列变化反映出来。 电子吸收光谱（Electronic absorption） 吸收光谱是研究配合物与DNA相互作用的比较直接的一种方法。金属配合物与DNA结合后，其电子结构会受到DNA的微扰，结果导致配体所处的环境发生改变，使吸收光谱的波长(MLCT峰，?max)和强度发生一系列的变化。 一般来说，当小分子以插入方式键合于双螺旋碱基对之间时，其吸收光谱表现出吸收峰（MLCT峰）的红移(red shift，why ?)及减色效应(hypochromicity, why ?)。 这是因为插入配体与DNA的碱基对发生π电子堆积后，使其π*空轨道与碱基的π电子轨道发生耦合后能级下降，从而导致π → π* 跃迁能减小，产生红移现象。同时，耦合后的π*轨道因部分填充电子，使得π → π*跃迁几率减小，产生减色效应。 Absorption spectra of Ru(II) complexes in Tris-HCl buffer upon addition of CT DNA. [Ru] = 20 ?M, [DNA] = 0~90 ?M. Arrow shows the absorbance changing upon the increase of DNA concentration. MDPZ 结合常数Kb的计算 [DNA]:DNA的浓度，?a、?f 和?b分别代表在各 DNA浓度下的、游离的和与DNA键合饱和的配 合物的摩尔吸光系数。 [DNA]/( ?a- ?f) = [DNA]/( ?b- ?f) + 1/Kb -1(?b- ?f) 配合物与DNA的结合方式也直接影响其稳态荧光光谱。当配合物以插入方式与DNA结合后，配体受到了DNA碱基疏水环境的保护，因此配合物的振动模式受到限制，或免受水分子的淬灭，因此其发光强度和荧光寿命一般会增强，同时其受阴离子淬灭剂的影响也较小。因此可以根据强度的变化来判断其与DNA作用的强弱。 稳态发光光谱 (Luminescent spectrum) Emission spectra of complex 1 (A) and 2 (B) in Tris –HCl buffer in the absence and presence of CT- DNA. Arrow shows the intensity change upon increasing DNA concentrations. Attention: 一般这些Ru (II)多吡啶配合物无 荧光 现象 配体中含有强的吸电子基团(-NO2、 -CN），DNA的存在与否都不能够使 配合物产生荧光。 那么这些配合物 的荧光是永久性关闭的。其原因是配合物受光激发后，电子被强的吸电 子基团捕获不易于从激发态回到基态，从而导致发光现象未能够产生。 2. 如果bpy环的6,6′(或者 phen的2,9 )上带有两个甲基, 不管这两个配体是作为插入配体还是辅助配体,DNA的存在