分子生物学课件第十章基因组学.pptVIP

第十章 基因组学 ※真核原核基因组特点比较 一 真核基因组 1.真核基因组DNA ⑴C值与C值反常现象 C值：一种真核生物单倍体基因组中DNA总 数 ※进化程度越高，C值理应越大 C值反常现象：某些两栖动物C值比某些哺乳动 物大：真核生物基因组大多 为非编码片段，DNA多不一 定编码蛋白多 ⑵真核DNA序列分类 不重复序列：占DNA总数的40%-80% 中度重复序列：占DNA总数的10%-40% 高度重复序列（卫星DNA）：占DNA总数的10%-60% ※单拷贝基因：无基因片段与之相同（重复）， 包括不重复序列 多拷贝基因：有很多基因片段与之相同（重 复），包括中度重复序列、高度重 复序列 2.组蛋白总结（H1、H2A、H2B、H3、H4、H5） 大多真核生物有H1、H2A、H2B、H3、H4 仅某些鸟、鱼、两栖类红细胞染色体无H1，而是有H5（H2A、H2B、H3、H4、H5） H5富含赖氨酸 组蛋白为亚基，组蛋白间可形成四级结构：八聚体 组蛋白单链上氨基酸排列不对称 组蛋白可修饰 3.几种常见非组蛋白 HMG：高速泳动蛋白,M小→泳动快 DNA结合蛋白：可与DNA结合的酶、蛋白 （RNA/DNA聚合酶、SSB等） A24 4.核小体（真核基因组基本结构） 分为：颗粒（140bpDNA+八聚体） 连接区（60bpDNA+H1） 八聚体：2×（H2A、H2B、H3、H4） 结构：颗粒：八聚体在中间，DNA分子盘旋在外 （盘旋八聚体1.65圈）直径10nm 颗粒间以连接DNA相连 ※H1作用：与八聚体作用，稳 定核小体结构 5.端粒与端粒酶 端粒：真核DNA末端结构，防止两DNA相连 端粒酶： 为反转录酶：属于DNA聚合酶（以RNA为模板 合成DNA） 功能：逆转录合成端粒、后随链冈崎片 段连接处 逆转录过程：RNA 单链DNA 双 链DNA 二 原核基因组 真核基因表达不连续原核基因表达连续原因： 复制： 真核DNA复制时：一个复制叉到复制终点时才可形成下一复制叉，进行下次复制（不连续复制） 原核DNA复制时：复制叉未到终点便产生下一个复制叉（可连续复制） 转录与翻译： 真核：转录产生的mRNA要通过核孔进入细胞 质，才能与核糖体结合进行翻译（不 连续表达） 原核：无核膜，转录产生的mRNA立即与核糖 体结合进行翻译（连续表达） ㈠原核基因组学 ㈡真核基因组学 一 综述 1.真核生物： 2.真核染色质： 3.真核基因表达特征： 4.真核两类基因调控： 二 真核基因结构与特点 1.真核基因组与原核基因组的不同： 2.几个概念 基因家族： 基因簇： 假基因： 3.简单多基因家族 定义：基因串联的前体rRNA（Pre-rRNA） 原核（细菌）： 真核： ※5SrRNA： 16S、23SrRNA： 4.复杂多基因家族： 定义：多个相关基因家族间由间隔序列隔开构成的独立转录单元 海胆组蛋白基因家族： 血红蛋白基因家族： 人α珠蛋白基因簇： β珠蛋白基因簇： 三 真核基因的断裂结构 1.外显子与内含子： 外显子与内含子连接区特点：高度保守的 特异性碱基序列 内含子的GT-AG法则：内含子结构序列：5’GT…AG3’ 2.外显子与内含子的可变调控： 组成型剪接： 选择型剪接： 四 真核生物DNA水平上的基因调控 1.定义： 2.基因丢失： 3.基因扩增： 定义： 真核基因研究实验系统： 非洲爪蟾卵母细胞系统： 果蝇的基因扩增： ※基因扩增的作用意义： 4.基因重排与变换： 基因重排： 基因变换： ※免疫球蛋白基因重排： 5.DNA甲基化调控 DNA甲基化调控机制： DNA甲基化主要形式： DNA甲基化抑制转录机制： DNA甲基化使X染色体失活机制： ※失活中心： ※Barr氏小体： 五 真核基因转录机器的组成 ※真核基因转录机器的组成 顺式作用元件： 定义： 包括：启动子、增强子、沉默子 反式作用因子： 定义： 包括：转录因子（TF） 两种活性： 1.真核启动子： 核心启动子：TATA区 上游启动子元件（UPE）：CG区、CAAT区 下游启动子元件： 2.真核转录模板： 3.RNA聚合酶Ⅱ： 结构： CTD： 4.TF： TF