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- 2017-05-22 发布于广东
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生物化学简明教程第三章核酸
核酸的发现和研究历史 核酸功能、分类和分布 基本碱基结构和命名 核糖和脱氧核糖 常见(脱氧)核苷酸的结构和命名 几种稀有核苷酸 碱基、核苷、核苷酸的关系 DNA 的一级结构 DNA一级结构的表示法 (1)DNA分子由两条多聚脱氧核糖核苷酸链(简称DNA单链)组成。两条链沿着同一根轴平行盘绕,形成右手双螺旋结构。螺旋中的两条链方向相反,即其中一条链的方向为5′→3′,而另一条链的方向为3′→5′。 (2)嘌呤碱和嘧啶碱基位于螺旋的内侧,磷酸和脱氧核糖基位于螺旋外侧。碱基环平面与螺旋轴垂直,糖基环平面与碱基环平面成90°角。 (3)螺旋横截面的直径约为2 nm,每条链相邻两个碱基平面之间的距离为0.34 nm,每10个核苷酸形成一个螺旋,其螺矩(即螺旋旋转一圈)高度为3.4 nm。 (4)双螺旋的力是链间的碱基对所形成的氢键。 碱基的相互结合具有严格的配对规律,A-T,G-C结合,这种配对关系,称为碱基互补。A T间形成两个氢键,G C 间 三个氢键。 在DNA分子中,嘌呤碱基的总数与嘧啶碱基的总数相等。 DNA的双螺旋结构稳定因素 DNA双螺旋构象的类型 组蛋白与DNA的结合 真核生物染色体DNA组装不同层次的结构 RNA的一级结构 DNA的紫外吸收光谱 分子杂交的原理示意图 核酸的变性、复性和杂交 Tm:熔解温度(melting temperature) (一)、sanger双脱氧链终止法 Cambridge的F.?Sanger在1977年发明用双脱氧链终止法测定单链DNA的序列。 反应体系组成:待测单链DNA ,模板,引物,四种dNTP(其中一种用32P/35S标记) 终止剂(ddNTP),DNA聚合酶 Sanger发明:两次获得诺贝尔奖 分别得到ddA ddT ddG ddC结尾的片段 腺苷酸及其多磷酸化合物 酵母tRNA Ala 的二级结构 “稀有核苷”是由“稀有碱基”所生成的核苷。 (1)氨基酸接受区包含有tRNA的3’-末端和5’-末端, 3’-末端的最后3个核苷酸残基都是CCA,A为核苷。氨基酸可与其成酯,该区在蛋白质合成中起携带氨基酸的作用。(2)反密码区与氨基酸接受区相对的一般含有7个核苷酸残基的区域,其中正中的3个核苷酸残基称为反密码 (3)二氢尿嘧啶区 该区含有二氢尿嘧啶。 (4) T?C区 该区与二氢尿嘧啶区相对, 假尿嘧啶核苷—胸腺嘧啶核糖核苷环(T?C)由7个核苷酸组成,通过由5对碱基组成的双螺旋区(T?C臂)与tRNA的其余部分相连。除个别例外,几乎所有tBNA在此环中都含有T?C 。 (5)可变区 位于反密码区与T?C区之间,不同的tRNA该区变化较大。 核酸的变性是指核酸双螺旋区的多聚核苷酸链间的氢键断裂,变成单链结构的过程。 变性核酸将失去其部分或全部的生物活性。核酸的变性并不涉及磷酸二酯键的断裂,所以它的一级结构(碱基顺序)保持不变。 能够引起核酸变性的因素很多。温度升高、酸碱度改变、甲醛和尿素等的存在均可引起核酸的变性。 RNA本身只有局部的双螺旋区,所以变性行为所引起的性质变化没有DNA那样明显。 测序过程 1.模板与引物杂交 2.引物的延长和合成阻断 四个试管分别加入 DNA聚合酶 dNTP 标记底物 终止剂不同 ddA ddG ddC ddT 四个试管中所有产物是一系列长度只差一个核苷酸的聚合链 3.电泳 ACGT次序 高压电泳 4.放射自显影得到直读图象 DNA酶法序列分析的原理 DNA (2nm) 核小体链( 11nm,每个核小体200bp) 纤丝( 30nm,每圈6个核小体) 突环( 150nm,每个突环大约75000bp) 玫瑰花结( 300nm ,6个突环) 螺旋圈( 700nm,每圈30个玫瑰花) 染色体( 1400nm, 每个染色体含10个玫瑰花200bp) 第六节 RNA的结构和功能 一、RNA 的分类及功能 1、核糖体RNA(rRNA) 蛋白质生物合成的场所-核糖体的主要成分 2、转移RNA(t RNA) 转移活化的氨基酸 3、信使RNA(m RNA ) 转录DNA上的遗传信息,并指导蛋白质的生物合成 二、RNA的结构 1、一级结构 2、空间结构: RNA是短的含不完全螺旋区的多核苷酸单链 * t RNA的三叶草型二级结构 * t RNA的倒L型三级结构 RNA分子中各核苷之间的连接方式(3′-5′磷酸二酯键)和排列顺序叫做RNA的一级结构 OH OH OH 5′ 3′
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