基于汕优63重组自交系群体的数量性状遗传剖析.pdf

浙江农业学报ActaAgriculturaeZhejiangensis，2014，26(2)：268-273 http：／／wwwzjnyxb．an 吴雯雯，陆兵．基于汕优63重组 自交系群体的数量性状遗传剖析[J]．浙江农业学报，2014，26(2)：268-273． DOI：10．3969／j．issn．1004—1524．2014．02．02 基于汕优 63重组 自交系群体的数量性状遗传剖析 吴雯雯 ，陆 兵 ，’ (南通农业职业技术学院，江苏 南通 226007；南通市农业生物技术重点实验室，江苏 南通 226007) 摘 要：以水稻汕优 63衍生的241个重组 自交系为供试材料，构建包括221个主效应 以及两两标记问221X (221—1)／2=24310个上位性效应在内的超饱和统计遗传模型。分别采用 E—BAYES，Stepwise，PENAL， LASSO和SSVS5种超饱和模型分析方法对该群体进行模拟试验，获得最优的分析方法 E．BAYES，并用该方 法对该群体的10个农艺性状进行 QTL分析，共检测到73个 QTL，分布于水稻的12条染色体上 ，进一步证实 该强优势籼型杂交组合的遗传构成。 关键词：汕优63；数量性状基因座 ；遗传构成；超饱和模型；变量选择法 中图分类号：S511．2 1 文献标志码：A 文章编号：1004—1524(2014)02-0268-06 GeneticarchitectureofquantitativetraitsbasedonShanyou63recombinantinbredlines WU W en—wen ．LU Bing ，， (NantongAgriculturalVocationalTechnologyCollege，Nantong226007，China； NantongKeyLaboratoryof AgriculturalBiotechnology，Nantong226007，China) Abstract：Inthispaper，basedonasetof241recombinantinbredlines(RIL)derivedfrom Shanyou63，the simulateddataofanoversaturatedgeneticmodelincluding221maineffectsand221X(221—1)／2=24310epitasis effectswereanalyzedbyfivemethods：E—BAYES，Stepwise，PENAL，LASSO andSSVS，respectively．Theresults ofthesimulationstudyindicatedthattheE—BAYESmethodprovidedaccurateestimatesofboththeQTLeffectsand locationwithveryhighstatisticalpower．Atotalof73QTLcovering12ricechromosomeswerefoundbythemethod ofE—BAYESunderlying10agronomictraits，whichprovidedadeeperunderstandingofthegeneticarchitectureofthe CrOSS． Keywords：Shanyou63；quantitativetraitloci(QTL)；geneticarchitecture；oversaturatedmodel；variableselection 汕优 63是中国种植面积较大的水稻 良种， 63的各种分离群体进行多个农艺性状的QTL定 自1994年李建雄等…利用汕优63的F2：3群体为 位，研究控制重要农艺性状的QTL在多年多点试 材料，对控制产量及其构成性状进行数量性状基 验条件下的表达规律，为数量性状的遗传改 良提 因座 (quantitativetraitloci，QTL)分析以来，刑永 供理论依据。这些研究大多是基于经典的QTL 忠等