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第二章DNA复制精选
增殖细胞核抗原(proliferation cell nuclear antigen,PCNA)在复制起始和延长中起关键作用。PCNA为同源三聚体,具有与E.coli DNA 聚合酶Ⅲ的β亚基相同的功能和相似的构象,即形成闭合环形的可滑动DNA夹子,在RFC的作用下PCNA结合于引物-模板链;并且PCNA使polδ获得持续合成能力。PCNA水平也是检验细胞增殖的重要指标。 DNA-pol δ和pol α分别兼有解螺旋酶和引物酶活性。在复制叉及引物生成后,DNA-pol δ通过PCNA的协同作用,逐步取代pol α,在RNA引物的3?-OH基础上连续合成领头链。随从链引物也由pol α催化合成。然后由PCNA协同,pol δ置换pol α,继续合成DNA子链。 (二)真核生物复制的延长发生DNA聚合酶α/δ转换 3? 5? 5? 3? 领头链 3? 5? 3? 5? 亲代DNA 随从链 引物 核小体 真核生物复制叉的延长: 染色体DNA呈线状,复制在末端停止。 复制中岡崎片段的连接,复制子之间的连接。 染色体两端DNA子链上最后复制的RNA引物,去除后留下空隙。 (三)端粒酶参与解决染色体末端复制问题 5? 3? 3? 5? 5? 3? 3? 5? + 5? 3? 3? 3? 3? 5? 5? 线性DNA复制的末端 端粒(telomere) 指真核生物染色体线性DNA分子末端的结构。 端粒的功能: 维持染色体的稳定性 维持DNA复制的完整性 端粒的结构特点: 由末端单链DNA序列和蛋白质构成。 末端DNA序列是多次重复的富含G、C碱基的短序列。 TTTTGGGGTTTTGGGG… 端粒酶(telomerase) 端粒酶RNA (human telomerase RNA, hTR) 端粒酶协同蛋白(human telomerase associated protein 1, hTP1) 端粒酶逆转录酶(human telomerase reverse transcriptase, hTRT) 组成: 端粒酶催化作用的爬行模型 双链DNA是大多数生物的遗传物质。某些病毒的遗传物质是RNA。少数低等生物如M13噬菌体,它的感染型只含单链DNA。原核生物的质粒,真核生物的线粒体DNA,都是染色体外存在的DNA。这些非染色体基因组,采用特殊的方式进行复制。 五、逆 转 录 和 其 他 复 制 方 式 逆转录酶(reverse transcriptase) 逆转录(reverse transcription) 逆转录酶 1、逆转录病毒的基因组是RNA,其复制方式是逆转录 RNA DNA 逆转录病毒细胞内的逆转录现象: RNA 模板 逆转录酶 DNA-RNA 杂化双链 RNA酶 单链DNA 逆转录酶 双链DNA 滚环复制(rolling circle replication) 2、噬菌体DNA按滚环方式复制和线粒体DNA按D环方式复制 是某些低等生物的复制形式,如?X174和M13噬菌体等。 3?-OH 5?-P 5? 5? 5? 3? 3? 3? 3? 5 滚环复制 5 ?? 5? 3? 3? 5? dNTP DNA-pol γ D环复制(D-loop replication) 是线粒体DNA (mitochondrial DNA,mtDNA)的复制形式。 D-环复制时需合成引物。mtDNA为双链,第一个引物以内环为模板延伸。至第二个复制起始点时,又合成另一个反向引物,以外环为模板进行反向的延伸。最后完成两个双链环状DNA的复制。复制中呈字母D形状而得名。 D环复制的特点是复制起始点不在双链DNA同一位点,内、外环复制有时序差别。 三、核酸外切酶的校读活性和碱基选择功能是复制保真性的酶学依据 复制按照碱基配对规律进行,是遗传信息能准确传代的基本原理。 此外还需酶学的机制来保证复制的保真性。 (一)核酸外切酶活性在复制中辨认切除错配碱基并加以校正 核酸外切酶(exonuclease)是指能从核酸链的末端把核苷酸依次水解出来的酶,外切酶是有方向性的。 A:DNA-pol的外切酶活性切除错配碱基;并用其聚合活性掺入正确配对的底物。 B:碱基配对正确, DNA-pol不表现活性。 DNA pol Ⅰ的校读功能 (二)复制的保真性依赖正确的碱基选择 DNA聚合酶靠其大分子结构协调非共价(氢键)与共价(磷酸二酯键)键的有序形成。 嘌呤的化学结构能形成顺式和反式构型,与相应的嘧啶形成氢键配对,嘌呤应处于反式构型。 遵守严格的碱基配对规律; 聚合酶在复制延长时对碱基的选择功能; 复制出错时DNA-pol的及时校读功能。 DNA复制的保真性至少要依赖 三种机制: 四、复制中的分子解链伴有DNA 分子
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