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2009级硕士研究生《蛋白质组学》试题 姓名：张运玲 所在大班：4班 学号：2009110670 得分： 一解释 1、Two-dimensional Gel Electrophoresis 二维凝胶电泳，是当前蛋白质组学研究中分辨率最高、信息量最大的分离技术。在比较蛋白质组学研究中，是不可缺少的少的手段。目前所用的的二维电泳体系是由Ofarrell等于1957年发明的，其原理是根据蛋白质的两个一级属性（等电点和分子质量），将一种蛋白质进行两次电泳，即：在第一个方向上按等电点高低进行分离，称为等电聚;在第二个方向（与第一次电泳成直角的方向）上按分子质量大小进行分离制备过程可分五大步骤：1，蛋白质样品的处理。2，第一向IEF（等电聚焦）。3，IPG（固相pH梯度）胶条的平衡。4，第二向电泳SDS（去污剂十二烷基硫酸钠存在下的聚丙烯酰氨凝胶电泳英文Matrix-Assisted Laser Desorption/ Ionization Time of Flight Mass Spectrometry，即基质辅助激光解吸离子化/飞行时间质谱是近年来获得快速发展的一种软电离生物质谱。仪器主要由两部分组成：基质附助激光解吸电离离子源（MALDI）和飞行时间质量分析器（TOF）。MALDI的原理是用激光照射样品与基质形成的共结晶薄膜，基质从激光中吸收能量传递给生物分子，而电离过程中将质子转移到生物分子或从生物分子得到质子，而使生物分子电离的过程。因此它是一种软电离技术，适用于混合物及生物大分子的测定。TOF的原理是离子在电场作用下加速飞过飞行管道，根据到达检测器的飞行时间不同而被检测即测定离子的质荷比（M/Z）与离子的飞行时间成正比 ，检测离子。 In silico强调使用计算机来解决生物学问题，In silico生物学是生物学与信息学的交叉学科。生物信息学从事对基因组研究相关生物信息的获取、加工、储存、分配、分析和解释。包括了两层含义，一是对海量数据的收集、整理与服务，也就是管好这些数据；另一个是从中发现新的规律，也就是用好这些数据。生物信息学已经成为蛋白组学研究中必不可少的组成部分，其应用包括：编码的DNA序列的寻找与分析,蛋白质序列信息的获取,蛋白质鉴定和性质预测,蛋白质结构和功能预测,蛋白质序列分析,数据的分析与整合 4、亚细胞蛋白质组学 亚细胞是比细胞结构更细化的结构一般是电子显微镜下才可见的细胞机构如线粒体，中心体，高尔基体，细胞壁上的纹孔等,已成为蛋白质组学新的主流方向,通过多种策略和技术方法,一些重要的亚细胞结构的蛋白质组不断的得到分析,而且已经深入到亚细胞器和复合体水平;另外,不仅局限于对亚细胞结构的蛋白组成进行简单分析,而且更注重功能性分析,将定量技术和差异分析引入亚细胞蛋白质组学,来观察此亚细胞结构的蛋白质组在某些生理或病理条件下的变化,这已经成为亚细胞蛋白质组学新的发展方向. 二、简要说明蛋白质组学在临床医学或疾病研究中的应用。 蛋白质组学在疾病的研究中占有十分重要的地位，旨在运用蛋白质组学的研究手段，通过比较正常和病理情况下细胞、组织或体液中蛋白质在组成成分、表达水平、表达位置和修饰状态上的差异，寻找疾病诊断和预后的特异性蛋白质，包括特异性抗原及相关抗原、受体、酶等，以及药物治疗的靶标等。通过对疾病相关功能蛋白质进行定性、定量和表征研究，深入了解这些蛋白质的结构和功能，揭示疾病过程中细胞内全部蛋白质的活动规律，为疾病发生、发展机制的阐明和早期诊断及治疗提供理论依据和解决途径。 三、人类血浆蛋白质组计划运用分馏技术、质谱技术和免疫分析手段，并且通过搜索蛋白质和基因库的注释，对人类血浆、血清中可检测和能确定的蛋白质建立数据库，其主要宗旨是优化血浆蛋白质组研究的各种技术手段，建立血浆蛋白质组研究的技术平台；描绘人类血液蛋白质图谱。下一阶段血浆蛋白质组学研究内容包括统一性的建立和生成标准操作规程，继续从HUPO的策划研究和其他公布的研究种发展和分析数据，促进和可能组织主要疾病相关性对早期诊断候选生物标志物的研究，最好对新诊断出疾病的病人进行分层，对目标治疗的基于路径的检测，并且设计预防性的干涉。 其长期目标是：1，综合分析人的血浆和血清蛋白成分。2，用有效的生物标记来验证随着时间的变化而产生的个体间变异的生物资料，生理方面：年龄，性别/月经周期等；病理：选定的疾病/特别病群；药理：普通药物等。 以确定变异在不同人群间和同一人群内部的程度。（3）测定全国人口变异程度PPP的下阶段包括(a)通过建立共识和新的研究规范化的操作步骤; (b)HUPO原创机构和其他出版研究数据继续的发展和分析; (c)主要与疾病相关的的候选，早期诊断更好层化最近被诊断的患者HCC）是一种高度恶性肿瘤，HBV病毒的长期持续感染是造成肝细胞癌的一个