STAT3 类肽抑制剂的定量构效关系1.PDFVIP

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th 10 OAPS Working Paper Series Paper No. 2013-046 Website: http://www.oaps.hk/ 1 STAT3 类肽抑制剂的定量构效关系 QUANTITATIVE STRUCTURE-ACTIVITY RELATIONSHIP OF SATA3 PEPTIDOMIMETIC INHIBITORS 刘泽宇 Author Zeyu LIU 指导教师 陈海峰 学院 生命科学技术学院 School of Life Sciences and Biotechnology 摘要 本文通过3D-QSAR 的手段分析阻止STAT3 二聚化的类肽抑制剂的定量构效关系。使用SYBYL 进 行分子叠合优化QSAR 模型。根据COMFA (comparative molecular field analysis )与COMSIA(Comparative Molecular Similarity Indices Analysis )两种分析方法,在静电场与立体场之外,引入了疏水场、氢键供/ 受体场分析结构。以建模组分子中活性最高的化合物A07 为模板,展示并分析了COMFA 与COMSIA 的力场等势图。最后通过给出两个模型的自预测、预测测试组分子活性数据的图表,构建 COMFA 及 2 COMSIA 模型,模型的相关系数r 达到0.985。确认COMSIA 模型对于小分子的构效分析更为理想,辅 以COMSIA 的氢键供受体场作参考,并据此给出了类肽抑制剂可能的改造前景。 关键词 :STAT3 类肽抑制剂,3D-QSAR,力场等势图,自预测 ABSTRACT In this paper, by means of an 3D-QSAR analysis of block STAT3 dimerization peptidomimetic inhibitors of quantitative structure-activity relationship. The use of SYBYL molecular composite optimized QSAR model. 1 “上海交通大学本科生研究计划”项目(T080PRP20012 )资助 上海交通大学 SJTU 1 作者 刘泽宇 生命科学技术学院 According to the COMFA ( comparative molecular field analysis ) and COMSIA ( Comparative Molecular Similarity Indices Analysis ) two kinds of analysis method, in the electrostatic field and stereo field, introducing hydrophobic, hydrogen bond donor / acceptor field field analysis of structure. In order to modeling group 2

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