第二篇 数量遗传学基础.ppt

第二章 数量遗传学基础 数量遗传学的形成过程 数量遗传学研究内容 数量性状的数学模型和遗传参数估测 选择理论和方法 交配系统（近交和杂交）的遗传效应分析 育种规划理论 基因频率和基因型频率 通径系数 数量性状遗传规律的研究步骤 例： 研究公猪（s）和饲养水平（ r ）及其互作效应对猪日增重的影响。 首先建立观测值的数学模型： 对数量遗传学研究内容的几点认识 统计学思想贯穿数量遗传学的全部内容，如遗传参数估计和育种值的预测等。 确定性与不确定性的矛盾时时体现，遗传参数和育种值是真实存在的，但只能通过样本来推断总体，通过表型值来预测育种值。 研究对象在个体与群体间相互转换 遗传与变异的矛盾 数量遗传学研究现状及发展前景 数量性状遗传基础理论方面 遗传参数估计的方法方面 选择理论和方法方面 资料处理和计算手段方面 宏观应用方面 新知识和技术方法的应用方面 第一节：群体的遗传结构 群体的遗传结构—基因频率、基因型频率 群体遗传平衡定律：Hardy－Weinberg定律 群体遗传平衡定律的推广—等位多基因、多基因座 群体遗传结构的影响因素 选择、突变、迁移、交配方式、遗传漂变 基本概念—群体 孟德尔群体（Mendelian population）：个体间有交配的可能性、在连续世代间有基因交换的有性繁殖群体，其中的所有基因可看作是一个基因库，各个体共享这一基因库资源，相互间可自由地进行基因交流。 一个个体在群体中存在的时间是有限的，除非发生突变，其遗传基础是终生不变的。一个群体则是可以长期存在的，群体可大可小、分布可广可窄，其遗传结构由所有个体的遗传基础决定，并受到各种各样的因素影响，可以随时发生变化。 基本概念—基因频率 基因频率（gene frequency）：在一个群体中某一等位基因的数量与占据同一基因座的全部等位基因总数的比例。 用百分率表示，取值范围在0到1之间，通常写成小数的形式，它是群体遗传特性的基本标志。 基本概念—基因型频率 基因型频率（genotype frequency）：在二倍体的生物群体中，某一基因座的特定基因型在其全部基因型中所占的比例。 用百分率表示，取值范围在0到1之间，通常也写成小数的形式，同一位点的所有基因型的频率总和为1，一般用大写字母表示。在只有一对等位基因（A和a）时，可形成三种基因型，即AA、Aa和aa，可用D、H和R分别表示各自的频率，这时 D+H+R=1。 基因频率与基因型频率的关系 在一对基因时： AA基因型频率为D，有2D的A基因 Aa基因型频率为H，有H的A和a基因 aa基因型频率为R，有2R的a基因 因此，A和a的基因频率分别为： 实例 人类MN血型是由一对等位基因（M，N）控制，它们是共显性的，可形成三种基因型（MM、MN和NN），其抗原类型表现为M型、MN型和N型。通过对69685个人的抽测，发现M型有21045人、MN型有34378人、N型有14262人。试估计基因和基因型频率。 因为基因型与所测的抗原类型一致，因此这三种基因型频率D、H和R分别为： M和N的基因频率分别为p和q： 基本概念—随机交配 随机交配（random mating），其基本含义是指在一个有性繁殖的群体中，任何个体与所有异性个体都有相同的交配机会，即任何一对异性个体的结合都是随机的。 群体遗传平衡定律——Hardy-Weinberg定律： 在随机交配的大群体中，若没有选择、突变、迁移等因素的作用，基因频率和基因型频率在世代间保持不变。 在任何大群体中，不论初始基因频率如何，只要经过一个世代的随机交配，一对常染色体上的基因就可达到平衡状态，没有其它因素影响时，其基因频率和基因型频率在以后的连续世代随机交配情况下保持平衡状态。 在平衡状态下，一对等位基因的基因频率与基因型频率的关系为： Hardy-Weinberg平衡 一对等位基因时的亲本交配类型和后代基因型频率 一世代的基因型频率和基因频率分别为： 群体遗传平衡的统计检验 群体遗传平衡定理的推广 一对等位基因完全显性 性连锁基因 性连锁基因频率在群体中的变化 复等位基因 实例 控制兔毛色有三个等位基因（C、ch、c），C对后两者显性，ch对c显性，只要有C基因就表现为有色，chch和chc表现为“八点黑”，即喜马拉亚白化（全身白色，耳、鼻、尾、脚为黑色），cc为白化（全身白色，眼球粉红）。据调查，在一随机交配的大兔群中，有色兔占75％、“八黑”兔占9％、白化兔占16％，试估计三种基因频率。 在随机交配的大群体中，各种配子随机结合如下： 实例 人类的ABO血型系统由三个等位基因控制（IA、IB、IO），IA与IB是共显性的、并都对IO显性，因此呈现出四种血型，IAIA、IAIO为A型血，IBIB、IBIO为B型血，IAIB