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鲍曼不动杆菌分子流行病学探究进展
鲍曼不动杆菌分子流行病学探究进展[摘要] 介绍了鲍曼不动杆菌的分子流行病学特征,并比较了鲍曼不动杆菌几种分子分型方法的优缺点。
[关键词] 鲍曼不动杆菌 分子流行病学 分子分型 流行病学的研究对象是某种疾病在特定人群中发生、传播、预防、控制的影响因素,暴发性感染及其病原微生物的研究是流行病学研究的重要内容。分子流行病学是流行病学的重要领域,它的主要工作是通过追溯病原体来源,为判断暴发性感染的范围、扑灭疫情、制订预防策略提供重要依据。上世纪80年代以来,DNA分子分型作为分子流行病学的重要技术迅猛发展,并为流行性感染的预防和控制提供了重要信息。
1 不动杆菌的分子流行病学 不动杆菌属(Acinetobacter)是需氧、不发酵糖类的革兰氏阴性杆菌,可分为6种:醋酸钙不动杆菌(A. calcoaceticus)、鲁菲不动杆菌(A. lwoffi)、鲍曼不动杆菌(A. baumanii)、溶血不动杆菌(A. haemolytius)、琼氏不动杆菌(A. junii)和约翰逊不动杆菌(A. johnsonii)。
不动杆菌是机会致病菌,鲍曼不动杆菌、不动杆菌属3型和13TU型是主要病原菌,常引起重症监护病房患者的呼吸机相关性肺炎、皮肤和软组织感染、创面感染、泌尿系统感染、继发性脑膜炎和败血症[1]。鲍曼不动杆菌、不动杆菌属3型和13TU型等临床相关菌株与环境菌株醋酸钙不动杆菌具有高度相似的生化和遗传表型,在临床诊断实验室常难以区分,因而被统称为醋酸钙-鲍曼不动杆菌复合体(A. calcoaceticus?A. baumannii complex,Acb complex)[2]。不动杆菌属3型、13TU型在临床上相对少见,但这可能与VITEK等临床常用菌种鉴定系统不能将其与鲍曼不动杆菌进行鉴别有关。醋酸钙不动杆菌是环境菌株,而非临床致病株;其他不动杆菌也少见于临床样本,一般认为毒性较低。约翰逊不动杆菌(A.johnsonii)、琼氏不动杆菌(A.junii)、鲁菲不动杆菌(A. lwoffii)等偶可引起散发医院内感染,多与有创性置管治疗有关且大多预后较好[3]。
与耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)等广泛传播病原菌的流行病学特征相似,鲍曼不动杆菌的流行病学特征包括:单克隆传播倾向、常引起医院获得性感染、多具有多重耐药特征。鲍曼不动杆菌常引起区域性暴发性院内感染[4-7]。其在医院内传播的主要途径是:接触被污染的医疗环境;接触未做好安全防护的医护人员。鲍曼不动杆菌感染的危险因素亦与其他多重耐药病原菌相似[8]。宿主因素为:重大手术、包括烧伤在内的严重创伤、早产儿。暴露因素包括:居住重症监护病房、住院时间、居住鲍曼不动杆菌曾经流行的病房、接触被污染的医疗设备。治疗相关因素包括:机械通气;静脉置管、尿路置管、体腔引流等置管相关治疗;多次有创操作和抗生素治疗史。
目前医院暴发性感染常发生于重症监护病房,而鲍曼不动杆菌是主要病原体,而重症监护病房大量使用的抗生素起到了对多重耐药菌株的选择作用。近年来临床分离鲍曼杆菌的多重耐药率逐年稳步上升,且近年来碳青霉烯类抗生素的耐药率也明显提高,部分菌株甚至对多粘菌素、替佳环素等不常用或新开发抗生素也产生了明显耐药性[1, 9-11]。现有研究证明,鲍曼不动杆菌的多重耐药菌株和抗生素敏感菌株在耐干燥和耐消毒剂、生物被膜、人类细胞黏附能力方面并无明显区别,因而多重耐药可能是流行克隆的主要特征[12-14]。
细菌克隆是指分离自不同时期不同地区,但具有相同的生物特征,因而可能来自同一祖先的菌株。在漫长的传播过程中,同一细菌克隆可能衍生出具有细微生物特征差别的亚克隆。基于扩增片段长度多态性(AFLP)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)的分子分型技术研究结果都提示:与其他广泛流行的病原菌类似,鲍曼不动杆菌在不同国家的暴发性流行都由有限的几个克隆引发,而非大量克隆的同时播散[5-20]。基于细胞封套蛋白谱、核糖体分型和AFLP指纹的研究首次证实了欧洲1型和2型克隆的存在[4]。此后不久,欧洲3型克隆亦被报道[7]。目前已知以上3个克隆的流行区域不仅限于欧洲,而是在世界范围内广泛传播,其流行区域也包括亚洲和中国[21]。
2 鲍曼不动杆菌的常见分型方法 1986年,Bouvet等建立了基于菌株生化表型的不动杆菌分类系统[22]。随后,Gerner-Smidt等于1991年将该系统进行了进一步简化,使其更加实用[2]。此后发展起来的多种基于遗传表型的分型方法可更准确地对不动杆菌进行鉴定。目前为止,不动杆菌属可分为33型,其中17型已得到正式命名。
目前可用于不动杆菌分子分型的技术有核糖体基因分型、AFLP、PFGE、MLST等,其中核糖体基因分型、AFLP、PCR/ES
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