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疆建凝口 第三甚涛津毫筏求论I云 2005.08.19-23
深海沉积物中细菌对有机碳源的反应:
细菌群落和酶活的变化+
曾湘,王风平,肖湘
005
国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室,国家海洋局第三海洋研究所,福建厦f.】361
摘要:深海是一个巨大的有机碳源贮存体,其在全球物质循环中起着重要的作用。深海沉积
物中广泛存在的细菌通过生理适应和类群改变参与了物质循环和有机物降解等多个过程,从
而不断适应自然环境的改变。迄今,对深海细菌群落对有机碳反应的动态过程了解甚少,且
几乎未涉及分子生态研究。细菌对有机碳输入有何反应?通过生化方法及分子微生物生态分
析有助于我们了解细菌这一群体在深海生态系统中的作用。在本文中,在深海沉积物(WP02.1,
几丁质,油脂),利用PNP特异荧光底物检测了沉积物中纤维素酶,几丁质酶,脂肪酶的活力
变化,并且通过DGGE分子生物学方法监测了细菌群落的种类及种属比例的变化;并分析比较
了深海和南极两个不同生态系统中,细菌应急反应的不同表现。由于深海沉积物环境中含有
较大量的脂肪酶活性,我们分离到潜在低温脂肪酶产生茵lO株,其Psychrobactersp.wp37和
Pseudo.alteromonas
高酶活的60%。蛋白分子量在85kDa。
关键词:深海沉积物,细菌,DGGE,胞外酶,脂肪酶
深海占据地球表面的70%,被认为是一个高压和低温的极端环境,由于深海本身没有生产
初级生产力(除了在热泉和冷泉产生少量以外),所有的有机物都是通过沉积作用从上层含生
产力的水层而来,在这个过程中,大量可溶有机物通过生物降解和化学反应被改变或利用消耗
了。容易降解的物质如淀粉,蛋白和脂肪大部分在水层食物网中被消耗了。到达深海底部的“残
余物”常常是难于降解的纤维素,几丁质,和各种类蛋白结构化合物。可以推断,有机物质的
痕量供应是深海生态环境最主要的限制因素,而非高压和低温。【1]有机物在水体的沉降过程中,
and
微生物降解【2,3,4]矛11浮游动物消耗减少了大量的有机物[5】。Wakehamlee发现从389—5068
的深度,氨基酸和脂肪酸减少了25.60倍,颗粒有机物减少了5倍。因此,随着深度的增加,
易于降解的物质,如蛋白质,碳水化合物,脂类不断减少。而许多颗粒有机物如几丁质,纤维
素,结构蛋白,各种细胞壁成分,这些大分子有更长的半衰期及不易被降解而将富集在深海沉
积物中。约80—90%的DOM(DissolvedMatter)以高聚物的形式存在,无法被微生物直接
Organic
吸收利用,只有通过胞外酶的解聚作用才能使它们转变成小分子有机物,而被异养微生物所吸
DOM中扮演着至关重要
收。胞外酶主要来源于细菌,其在降解POM(ParticalOrganicMatter)并N
+863项目资助:深海微生物研究平台技术构建(2004AA621010)
+通讯作者。E—mail:xxwfp@public.xm.t¨.ca
117
覆建蠹n 第三晷海洋毒技术{幺坛 2005.08.19.23
的角色。细菌群落结构在对这些水解酶类的调节过程中起着至关重要的作用。脂肪酶
(EC3.1.1.3)又称三酰基甘油酰基水解酶,是指分解或合成高级脂肪酸和丙三醇形成的甘油三
酯酯键的酶。脂肪酶产生菌广泛存在于自然环境中,深海沉积物中分离的低温脂肪酶产生菌具
有极高的潜在工业应用价值。
两太平洋“暖池”位于从太平洋西部到印度洋东部的赤道两侧,长期年平均表层水温超过
28。C,是海气相互作用最为强烈的热带海区,也是全球大气环流的能源区。近年来的研究结果
表明,该海
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