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2.微生物代谢工程的基本概念
* * 因此,典型的理想载流途径应该由以上五段承担不同代谢分工的依次衔接的代谢途径组成。这就是载流途径的“五段式”。在这条载流途径上流动的代谢主流对应地也有五段,这就是代谢主流的“五段式”。 张星元:发酵原理(讲座) * * 15.工业发酵的五字策略 在“ 载流路径 ” 、“ 代谢主流 ” 和“ 五段式 ” 等概念的基础上,从统筹的角度出发,提出作为一个整体用于设计育种以及发酵工艺控制的 五字策略 : “ 进、通、节、堵、出 ” 【下续】 张星元:发酵原理(讲座) * * ①进,促进细胞对碳源营养物质的吸收;②通,使来自上游和各个注入分支的碳架物质能畅通地流向目的产物;③节,阻塞与目的产物的形成无关或关系不大的代谢支流,使碳架物质相对集中地流向目的产物;④堵,消除或削弱目的产物进一步代谢的途径;⑤出,促进目的产物向胞外空间分泌。 张星元:发酵原理(讲座) * * 16. 代谢网络的节点及其刚性 微生物代谢网络中的途径的交叉点(代谢流的集散处)叫做节点(node),微生物自动抵制节点处代谢物流量分配比率的改变的特性叫做节点的刚性。节点的刚性取决于微生物代谢的自动调节机制。因此在应用 “ 五字策略 ” 制订育种方案时必须认真考虑节点刚性问题,尽量采用解除反馈调节的育种手段。 张星元:发酵原理(讲座) * * 17.代谢网络的刚性 微生物自动抵制代谢网络中代谢物流量分布的改变的特性叫做代谢网络的刚性。代谢网络的刚性与主要刚性节点的刚性大小、分布及数量密切相关。 张星元:发酵原理(讲座) * * 18.微生物活细胞及其经济性 微生物活细胞是个远离平衡状态的开放体系,是一种靠消耗能量而维持低熵的稳定动态的特殊结构——耗散结构。 【下续】 张星元:发酵原理(讲座) * * 从微生物细胞对能量和化学物质的内外交换、增收节支、协调自律等客观规律出发,把微生物细胞作为按特殊的经济规律运行的经济实体来看待,并且把这种按特殊的经济规律运行的有利于生存竞争(生存保障)的新陈代谢特性叫做细胞经济性。细胞的经济性可以以生成细胞的质量与消耗底物的质量之比值——细胞经济系数来衡量。 张星元:发酵原理(讲座) * * 19.正常代谢和竞争型细胞经济 微生物在生存竞争中进化的方向是发展其自身的适应能力和提高细胞运行的经济系数。经生存竞争而幸存下来的野生型微生物在其所栖身的环境中是富有竞争能力的,并且它们的代谢中间物在代谢网络中的分布及细胞经济运行状况有利于细胞生长、繁殖和在竞争中获胜。在上述条件下,细胞处于正常代谢状态,细胞经济体系呈现竞争型细胞经济的特色。 张星元:发酵原理(讲座) * * 20.异常代谢和导向型细胞经济 如果工业生产要求微生物在胞外累积某种代谢中间产物,则必须对微生物的代谢流进行导向。根据已获得的代谢分析的信息,应用“五字策略”有可能设计理想载流途径和配套的发酵培养工艺路线和工艺条件,进而改造菌种、调整工艺,将代谢主流导向理想载流途径。在导向成功的情况下,细胞处于异常代谢状态,细胞经济体系呈现导向型细胞经济的特色。 张星元:发酵原理(讲座) * * 21.细胞经济受到严格的制约 ? 工业发酵依靠细胞群体的代谢来获得产品,导向型细胞经济固然有利于特定的代谢产物的生产,但竞争型细胞经济向导向型细胞经济的转化受到能量代谢、还原力的平衡等条件的严格制约(以保证有熵的输出),表现出代谢网络的刚性。若细胞经济实体的运行状态过度偏离竞争型运行状态,活细胞的高度有序状态将走向无序,最终导致细胞经济的崩溃。 张星元:发酵原理(讲座) * * 22.信息流指导下的工业发酵 在工业发酵生产中,可以把微生物细胞看作是细胞机器,它们进行能量代谢和物质代谢;同时又可以把它们看作是信息处理器,它们复制和传递自己的生物信息,接收细胞内外的物理、化学甚至生物信息,并在对内外信息流进行综合处理的基础上,发出代谢调控的指令,在网络刚性的范围之内控制微生物细胞自身的生命活动。 张星元:发酵原理(讲座) * * 23.限制性遗传信息之谜 可以推测在每个微生物细胞的遗传物质中必有其限制性的生死攸关的遗传信息,它们规定微生物细胞生命活动的基本的代谢网络及其调节机制。这些遗传信息是微生物细胞能够自主生活与独立存在的依据,也是微生物对环境的有限的适应性以及设计育种的计划往往不能完全兑现的内在原因。
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