链球菌和放线菌的胞外代谢物代谢组学鉴定.pdfVIP

国际口腔医学杂志第38卷4期2011年7月 www．gjkqyxzz．cn ·399· 链球菌和放线菌的胞外代谢物代谢组学鉴定 袁艺 郭强 李明云 熊萍 李继遥 朱殊 李燕 龚其美 肖晓蓉 肖丽英 (口腔疾病研究国家重点实验室，四川大学 成都 610041) 摘【要】 目的 检测不同口腔细菌的细胞外代谢产物，发掘各种细菌的特征性代谢谱图，探讨代谢组学在 口腔 细菌鉴定中的作用 。方法 取3组细菌生长对数后期培养液，行磁共振氢谱仪检测和主成分分析 (PCA)及最小 偏二乘法判别分析 (PLS—DA)，鉴别各个细菌间的代谢产物。结果 3组细菌的代谢产物明显不 同，各 自聚集、 分布区域明显分开；PLS—DA区分效果好于PCA。结论 细菌细胞外代谢产物的代谢组学研究，有望成为 口腔 细菌鉴定和分析的新技术。 关【键词】代谢组学； 磁共振；模式识别； 口腔细菌 冲 图分类号】R780．2 文【献标志码】A d【oi】 10．3969j／．issn．1673—5749．2011．04．008 AppHcation ofmetabonomics for analysisof extracellar metaboHtesofStreptococcus and Actinomycetes YuanYi，GuoQiang,LiMingyun,XiongPing,LiJiyao，ZhuZhu,LiYan,GongQimei,XiaoXiaorong,XiaoLiying． (StateKeyLaboratoryofOralDiseases，SichuanUniversity,Chengdu610041，China) A【bstract】Objective Toinvestigatetheapplicationofmetabonomicsinresearchoforalbacteria，throughde- tecting differentoftheextracellularmetabolites，and find the characteristicmetabolicprofileof each oralbacteria． Methods H‘-nuclera magneticresonance(NMR) spectrawereobtainedfrom eachmicrobialcuhureatlateexpo- nential growth phase．Theobtained data wereprocessed by both theunsupervisedprincipal componentanalysis (PCA)andthesupervisedpartialleastsquraesdiscriminantanalysis(PLS-DA)tofindoutthedifferencesamong the three rgoups．Results These H-NMR spectrorgamsofeach bacteria areobviously different．Th eresultof pattern recongnition presentedmraked clusteringbetween the threergoup．PLS-DA naalysishasthebetter effect to differentthese sma ples．Conclusion Th eresults indicated thatthe H-NMR-based extracellularmetba onomic approach isa feasibleand efficientmethod fordifferentiatingandanalyzingoralbacteria． K【eywords】 metbaonomics： nuclera resonance： patternrecognition： oralbacteria 广义上，代谢组学是一门通过定性和定量等 nuclearmagneticresonance，H—NMR)技术对