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SNPs的发展与人类健康 一、 SNPs的由来及概念 SNPs是英文Single nucleotide polymorphisms 的缩写，中文译为单核苷酸多态性。通俗地讲，可以认为是人类DNA序列的差异。具体地说，SNP指基因组序列中单核苷酸（A，T，C，G）改变时发生的DNA序列的多态性变化，即指基因组内特定核苷酸位置上存在两种不同的碱基，其中最少一种在群体中的频率不小于1%。 人类基因组的30亿个碱基中，大约每300到500个碱基就有一个SNPs发生，整个人类基因组大约有2000万SNPs。SNPs既能在编码基因又能在非编码基因中发生，在编码基因中出现称做cSNPs。尽管多数 SNPs不影响细胞功能，但是科学家认为SNPs确实可以使人易患病或影响对药物的敏感性。 尽管遗传密码由4种碱基组成，但SNP通常只是1种二等位基因(biallelic)，或二态的遗传变异。例如一个SNP可能把DNA的序列AAGGCTAA改变为TAGGCTAA。SNP作为一种碱基的替换，大多数为转换，而颠换较少，转换与颠换之比大约2∶1。SNP在CG序列上出现最为频繁，而且多是C→T，原因是CG中C即胞嘧啶常为甲基化的、自发地脱氨后即成为胸腺嘧啶。 二、 SNPs的研究意义 SNPs是伴随着人类基因组计划 (HGP)发展起来的，HGP下一阶段的另一任务是尽快鉴定人类DNA序列的差异，即单核苷酸多态性（SNPs）。虽然人类99%以上的DNA序列是相同的，但是DNA序列的变化对人类对疾病、环境攻击（比如细菌，病毒，毒素和化学物质）、药物和治疗的反应产生重大影响。这就使得SNPs对生物医学研究、药物开发、医学诊断和法医学发展有重要意义。除了基因制药、诊断、生物医学研究方面的应用，SNP图谱还有望被用来识别基因组上成千上万个附加标记，以简化HGP研究者绘制的很大的基因组图谱。 （一） SNPs与疾病的关系 为什么有人容易得糖尿病，有人容易得癌症，有人易肥胖，基因在这里起了主要作用。基因在决定个体的正常表型，即形态、代谢和免疫状态等方面起着决定性的作用。通过赋予个体对疾病的易感性或抵抗力，以及影响机体与环境因素的相互作用，基因也对任何疾病的发生发展起着重要作用。人们希望能识别这些基因，以加深对疾病的认识，从而改进疾病的诊断预防及治疗。 由于技术条件的限制和认识上的差距，迄今为止疾病的遗传研究大多是从单个基因入手，很少从整个基因组及其功能状态考虑。随着SNPs的不断发现和人类第三代遗传标记图的绘制，现在已有可能描绘在某一疾病发病时或发育阶段中多个基因位点甚至整个基因组的状态。由于 SNPs在基因组中分布广泛，人们希望通过研究可以对发病率高的多基因疾病产生更深的认识，他们相信SNP图谱将有助于认识复杂的多基因疾病，如癌症、糖尿病、血管性疾病和某些精神性疾病。这些疾病很难用传统寻找基因的方法来确定，因为仅仅一个基因的改变对其影响不大。目前SNPs可以在以下几个方面发挥作用： 1、 确定疾病相关基因； 2、 寻找可以带来新治疗方案的靶向基因； 3、发现预测治疗效果的基因。 SNPs的应用可分为以下三个阶段： 第一阶段：制作出覆盖整个基因组的足够高密度的SNPs图谱。SNPs的物理定位与微卫星定位相似，SNPs至少可以作为遗传标记。在指定人群中，如果SNPs覆盖基因组的范围低于10%，它的意义则大打折扣。 第二阶段：通过对比健康和患病人群SPNs发生的相对频率，可以对特定某种疾病在基因组上进一步定位。可以进一步提高这部分基因组的分辨率。 第三阶段：利用SNPs可以在细节上研究遗传的变化。在这一阶段可以利用固定数目（10-100）的和某种特定疾病相关的基因进行遗传变化研究。在这一阶段，遗传上变化频率越低，可利价值越大。人们希望找到与疾病发病初期相关的基因。大多数SNPs在非编码区找到，而鉴定出编码区SNPs即cSNPs的意义非常重大，它往往代表基因型和表现型的改变。 （二） SNPs与环境的关系 不同的种族、人群对外界环境因素变化的反应不同；在同样的环境下有人很容易得病，为什么会这样？对SNPs的研究可以给出一定的答案。 在疾病发生、发展的过程中，个体或群体对环境致病因素的易感性起着重要作用。这种易感性的遗传基础是基因组的结构差异或（和）表达差异。SNPs有助于阐明这些差异。人类的易感性也并不完全由基因决定。在环境致病因素作用下的基因表达差异起着更为重要的作用。随着DNA芯片在基因表达研究中进一步应用，在理论上只需很少的个体或标本就可确定环境因素对基因组表达的影响并找出易感基因。 (三)SNPs与药物的关系　 在利用药物进行疾病治疗时，不同的病人治疗效果有时差异显著。造成这种差异的原因是由于药物本身在不同个体体内活化、代谢、