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基因工程中限制酶切割几个问题

基因工程中限制酶切割几个问题限制酶全称限制性核酸内切酶,能识别并切割具有特异序列的双链DNA分子,主要从原核细胞中分离纯化而来,迄今为止,已分离出来的限制酶约有4 000余种。作为基因工程中非常重要的一种工具,它应用广泛,是历年高考中能力题的命题着力点,但由于书本相关内容介绍简单,而考试命题时常有所拓展,很多师生在解答此类题目时常发生认知冲突,产生很大的困惑,为此,笔者总结了教学过程中的一些问题,供大家参考。 1 限制酶能将外来的DNA切断,使之失去活力,对自己的DNA却无损害作用的原因 在人教版《生物必修2“T2噬菌体侵染细菌”的实验就已经告诉我们,原核生物容易受到自然界外源DNA的入侵,这一点学生很容易理解并接受,但对于原核生物细胞内的限制酶只切割外源DNA,而不切割自身DNA,却难以理解。 在长期的进化过程中原核生物形成了一套完善的防御机制,以保持自身遗传的相对稳定性。当外源DNA侵入后,限制酶就将其切割掉,使外源DNA不能发挥遗传效应,但限制性内切酶往往与一种甲基化酶同时成对存在,它们具有相同的底物专一性,具有识别相同碱基序列能力。甲基化酶的甲基供体为S-腺苷甲硫氨酸,甲基受体为DNA上的腺嘌呤与胞嘧啶。当限制酶作用位点上的某一些碱基被甲基化修饰后,限制酶就不能再降解这种DNA了,所以限制性内切酶只降解外源入侵的异种DNA,而不分解自身DNA,在消解外源DNA遗传干扰的同时又保护了自身遗传特性的稳定。 2 一种限制酶只能识别一种特定的脱氧核苷酸序列吗 在人教版《生物2?遗传与进化》P102中,明确指出:“一种限制酶只能识别一种特定的核苷酸序列,并在特定的切点上切割DNA分子”,但真实情况却并非如此,有少数限制性核酸内切酶可以识别两种以上的核苷酸序列。如HindⅡ的识别序列为5′…GTPy↓PuAC…3′,其中Py=C或T;Pu=A或G。这样HindⅡ的识别序列实际为四种,如图1所示。 3 不同种类的限制酶识别的核苷酸序列一定不同吗,切割位点一定不同吗 有一些限制酶虽然来源不同,但识别的是同样的核苷酸序列,这类酶称为同裂酶,而同裂酶的切点位置可能相同,也可能不同,如图2和图3所示。 (1) 切点位置相同: (2) 切点位置不相同: 4 如果不同种类的限制酶分别识别不同的核苷酸序列,是否一定产生不同的黏性末端 有些限制酶虽然来源各异,识别的靶序列也不相同,但切割双链DNA后却可以产生相同的黏性末端,这一类限制酶称为同尾酶,如图4所示。 值得注意的是,BamHⅠ和BglⅡ切割DNA后虽然产生了相同的黏性末端,但如果这样的黏性末端相结合,将不能再被BamHⅠ或BglⅡ识别并切割。 5 构建酶切图谱时,确定限制酶切点位置的方法 人们为了了解基因的结构,通常选取某一特定长度的DNA分子,用多种限制酶单独或联合切割,再通过电泳技术将酶切片段进行分离,计算相对大小,以确定每一种限制酶在DNA分子中的切点位置和相对距离,即构建酶切图谱,一般以直线或环状图式表示。酶切图谱的构建在DNA序列分析、基因文库的构建等工作中具有重要意义,那究竟如何构建酶切图谱呢?例如用限制酶EcoRV、MboⅠ单独或联合切割同一种质粒,得到的DNA片段长度如图5所示。 质粒为环状双链DNA分子,一次切割只能产生一个片段,故EcoRV切点数目为1,MboⅠ切点数目为2。将单酶切片段与双酶切片段逐一比较,绘制酶切图谱。图5中MboⅠ切割后产生一个大片段11.5 kb与双酶切产生的5.5 kb和6 kb重叠,确定EcoRV的切点位置在11.5 kb中。因此给出的质粒及酶切位点如图6所示。 1

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