中草药有效成分化合物与黄嘌呤氧化酶的分子对接及药物特性研究.pdfVIP

第 30卷 第 l期 计算机与应用化学 Vo1．30，No．1 2013年 1月 28日 ComputersandAppliedChemistry January 28，2013 中草药有效成分化合物与黄嘌呤氧化酶的分子对接及药物特性研究 冯荣楷 ，郭潮辉，周志敏 (澳门理工学院高等卫生学校，澳门特别行政区，999078，中国) 摘要：运用 Surflex—Dock和FAF—Drugs2对 5种能治疗高尿酸血症的中草药的65个成分与黄嘌呤氧化酶(简称 xo)进行柔性分子 对接和 ADMET预测研究，并分析它们在 XO的活性位点的结合模式。结果显示当中的51个化合物有比常用西药别嘌呤醇更 佳的打分函数和更稳定的结合模式。其中以花旗松素3．O．．L一鼠李糖苷、阿斯特酚苷和虎杖甙的打分函数最高，它们亦被预测 为有良好的口服药物特性，可用于研发新型黄嘌呤氧化酶抑制剂。 关键词：黄嘌呤氧化酶；分子对接；计算机ADMET预测；Surflex—Dock 中图分类号：TQ015．9；TP391．9；06—39 文献标识码：A 文章编号：1001—4160(2013)O1-08—12 DOI： 10．11719／tom．app．che 1 引言 化酶 J，如肉桂、野菊花和花 曲柳。这些中草药拥有许多 具有 良好药物性质的有效成分 】【…，此外亦有研究显示 黄嘌呤氧化酶(EC 1．17．3．21是生物体内的 1种能代 61％的小分子药物都是由草药中的活性成份提取或受其 谢嘌呤核苷酸的酶，它能够催化黄嘌呤和次黄嘌呤，进 启发所获得的l【。本研究就采用 Surflex—Dock分子对接 行氧化反应，生成尿酸和 自由基。因此抑制此酶能预防 和 FAF．Drugs2软件 去探讨及分析不同中草药活性成 和治疗高尿酸血症，减少患痛风或肾结石的等疾病的机 份对黄嘌呤氧化酶的抑制能力及其药物特性。 会Ilj。目前患有高尿酸血症的占全世界人口的约为 5％～ 30％，其中被诊断患有痛风的男性约有 13％，女性则有 2 材料与方法 5％2J【，可见高尿酸血症的普遍性和寻找其高效疗法的需 要性。此外黄嘌呤氧化酶抑制剂可以降低体 内的自由基， 2．1 小分子准备 能减少多种细胞的损伤，有助预防老年痴呆症、肾脏病 本研究选取了 5种被证实能有效抑制黄嘌呤氧化酶 和组织纤维化等 j。 的中草药中的65个活性成份进行研究。这 5种草药是肉 目前治疗痛风药物大概能分为利尿酸药和黄嘌呤氧 桂、野菊花、花 曲柳、土茯苓和虎杖，他们的提取物对 化酶抑制剂(X0 inhibitor)两大类。常见利尿酸药如丙磺 黄嘌呤氧化酶的抑制 常数 (1C50)分别为 18~tg／ml、 22 ~tg／ml、28~tg／ml、33~gm／l和 38~tg／ml【。这5种草 舒(probenecid)、苯磺唑酮(sulfinpyrazone)和苯溴香豆酮 药的 65个已知成份的分子结构于台湾中医药资料库_l3J (benzbromarone)等，它们能加快尿酸从尿液中排出，不 过其有效性和病人耐受性都不及黄嘌呤氧化酶抑制剂， 下 载 ， 采 用 ChemBioOmce 2008 (CambridgeSoft，