牙鲆微卫星标记的筛选及群体遗传结构分析-生物通.pdfVIP

HEREDITAS (Beijing) 2010 10 , 32(10): 1057―1064 ISSN 0253-9772 研究报告 DOI: 10.3724/SP.J.1005.2010.01057 牙鲆微卫星标记的筛选及群体遗传结构分析 1, 2 1 1, 3 1, 2 2, 3 王蕾 , 张立冬 , 万玉美 , 谭照君 , 孙效文 1. , 116023; 2. , 150070; 3. , 100141 采用生物素-磁珠吸附微卫星与质粒二次检测相结合的方法克隆牙鲆微卫星, 并利用所得到的引物分析 野生群体遗传结构。共获得2 805 个阳性克隆, 测序得到3 120 个含微卫星的序列。其中完美型、非完美型和 混合型分别占57.97% 、7.25%和34.78% 。用Primer 3.0 软件设计牙鲆微卫星引物, 从中筛选出具稳定多态性的 30 对, 分析中国黄海、渤海海域4 个不同海区牙鲆野生群体(大连、北戴河、丹东、青岛)遗传结构。结果显示: 有效等位基因数为 3.93 ～9.94, 平均为 6.95; 观测杂合度为 0.532~0.895, 平均为 0.753; 期望杂合度为 0.635 ～ 0.902, 平均为0.820; Hardy-Weinberg 平衡指数(d) 的变化范围为−0.247~0.512, 其中7 个位点表现为杂合子过剩 (d0), 其余位点表现为杂合子缺失(d0) 。聚类分析显示: 4 个群体聚为两类, 大连与丹东聚为一类, 北戴河与青 岛聚为一类。 牙鲆; 微卫星; 遗传结构 Isolation of microsatellite markers from Paralichthys olivaceus and its application in genetic structure analysis 1, 2 1 1, 3 1, 2 2, 3 WANG Lei , ZHANG Li-Dong , WAN Yu-Mei , TAN Zhao-Jun , SUN Xiao-Wen 1. Life Science and Technology Institute , Dalian Fisheries University, Dalian 116023, China; 2. Heilongjiang Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Harbin 150070, China; 3. Center for Applied Aquatic Genomics, Chinese Academy of Fishery Sciences, Beijing 100141, China Abstract: Magnetic bead enrich-method and plasmid detection-method were used to isolate microsatellite DNA from Paralichthys olivaceus genome. The microsatellite markers were applied