第一章 北京地区蔬菜保护地根结线虫种类调查
置显微镜观察雌虫会阴花纹,并照相。
1.2.4分子生物学鉴定方法
过测序、比对rDNA—ITS序列确定根结线虫分类地位。
1.2.4.1单条线虫DNA的提取方法
参照廖金玲(2001)微量提取法并加以修改。在体视镜下用解剖针挑取已分离
好的根结线虫幼虫或雌成虫;用蒸馏水冲洗,在I%次氯酸钠溶液中消毒三分钟,
DTT,1.125%
再用蒸馏水冲洗三次以上。挑入滴有10肛l预冷WLB液(2.5mmol/L
mmoVL
mmo/咒KCL,25
吐温20.0.025%明胶,2.5倍PCR缓冲液f125
mrnol/L
Tris.CL(pH8.3),3.75MgCL2])的载玻片上,在解剖镜下用消毒的眼科手
术手将线虫切成多段,然后迅速吸取含尽量多的这些线虫片段的悬浮液8uL,加
入含10u
rain。即得到DNA悬浮液,在--20℃条件下保存。
后以14000rpm离心l
1.2.4.2PCR扩增
引物:
et
应用Vrmn
5-TTOAT
et
于核糖体DNA的18S基因和5.8S基因上(PoweLa1.1997)(图i-1)。
lTSl lTS2
188 f 588 7 28S
图1-1扩增序列位置
PCR反应体系:
PCR Mix
采用便捷式PCR试剂盒2×TaqSuperf清华大学北京天为时代科
技有限公司)。其中己加入PCR反应所需的全部试剂(除模板和引物外),Taq
KCl、1,5mM
MasterMix反应终浓度:10mMTris.HCI(pH8.3)、50raM
MgCL2、
tOuMdNTPeach、1U
第一章 北京地区蔬莱保护地根结线虫种类调查
时,只需取适量混合液,加入模板和引物后加水辛}足体积即可进行反应。
反应体系为50
uL,按下表配制混合液:
Templar 0.5肚g
Primer 1uL
rDNA2(10”旧
PrimerrDNAl 1uL
58s(10l_tM)
2xHifi PCR 25uL
LongTaqSuperMix
ddH20 22.59L
总体系 50}_tL
反应条件:
94C预热4min,
94℃变性lmin]
60℃褪火]rain
L35个循环
72℃延长1.5min
。
72℃保温lOmin
4C保存
1.
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