应用DGGE技术的分析白色念珠菌定植对小鼠肠道微生物区系的影响.pdf

i}tJDGGE技术分析向色念玮曲定转聍小耐蝣道微l物R糸的彩响 文献综述 1．肠道细菌与宿主共生的研究进展 我们生活住一个复杂而多样的微生物世界里，但奇妙的足我们自己的肠道内也有 一个复杂多样的“小微生物世界”，即肠道微生物区系tgutmicrobiota)。据估计， 人的肠道微生物区系大约具有1011个微生物细胞，其数量远远超过身体其它部俯的细 菌总和，并且比人所有体细胞和生殖绌胞的总数要高出一个数量级…。在同前所知的 的微生物区系看作为一种微生物组成的生理“器官”，由不同的微生物种槿构成，不 仅在它们Lj宿主之间存在着复杂的相互作用，而且在它们自身之问也存在着复杂的相 互作用。在肠道内，它们消化宿主不能消化的食物残渣，储存和重新分配能量，介导 crobj 生理上重要的物质转化。就基因数量而言，人肠道微生物组(mi ome)——肠道 微生物区系所有微生物基因组的总和——包含的基冈数量是人类基劂数量的100倍以 上。‘，这也赋r了我们人类在自身进化过程中所不具备的生理功能。 从早期的微生物学家梅基尼可丈(Mechnikov)到令天的微生物学家一直强调理解 肠道微生／物区系在人类健康和疾病中的重要性。然而，由丁肠道微生物区系的组成和 结构复杂，长期以来我们对其发挥牛理功能的作片j机制一卣了解其少。随着分子生物 学技术的发展和无菌动物的成功繁殖，为我们全[酊地了解肠道微生物区系的生理功能 提供了有力的工具。 1．1肠道细菌微生物区系的复杂性和多样性 要了解肠道微生物区系的生理功能，首先需要了解肠道细菌微生物区系的结构和 组成。传统的研究是通过细菌培养结合尘化鉴定的方法米分析其组成，人肠道可培养 如大肠杆菌(1Z‘；che』uchin 直接进行显微观察的结果发现，大多数肠道微生物形态iI可培养微生物形念是小一致 的。其原冈可能与肠道微牛物离，l：了相应的乍态f证而死L引起的。为了避免培养方法 f rRNAsmall 的局限，基于SSU subunit rRNA)基因序列的DNA指纹图谱技术和克隆测 序方法丌始被用丁研究肠道微生物生态系统‘1…。 叫目DUDE技术分析白色念珠曲定植对1、鼠肠；thOr{1物‘f系，奠氍响 rDNA的 同前州肠道细菌微生区系的纠成：{=¨结构较令面的什计丰要是基丁细菌168 rRNA基闪(r1)NA)广泛存任于原核生物中，并且 克隆测序分析完成的。这是由T-165 16S rDNA)≯列中存在着多个种属特异性结构域(包括9个rIJ变区)，以及存在大量的已 知序列为推测细菌系统发生关系提供了可靠性…。迄今，存GenBank数据库中的168 rDNA序列来源人的肠道微7L物，并日． rDKA序列已超过了200000，其巾只有1822个168 1 rDNA系统性分类分析中， 689个168rDNA序列代表了未能纯培养的细菌序列9。在168 rDNA序列相似性作为限制属和种的 通常我们分别以95％和98％(或者是99％)的168 rDNA克隆测序分析揭示，微生 标准。对成人肠道粘膜和粪便中微生物区系的细菌16S 物区系包含了9个细菌门”～…。；其巾以厚壁菌门(凡rmfcutemphylum)和拟杆菌门 z口一oides phylum)， (肋c phylum)的细菌占主导”一…，而变形菌门(Proteobacter／a