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解脲脲原体DNA模板制备方法探究比较
解脲脲原体DNA模板制备方法探究比较
作者:盛敏玲,濮跃晨,朱长太,姚余有,赵政龙,卫广英,赵卫东,高婷
【关键词】 解脲脲原体;检测;模板制备;PCR
[摘 要] 目的:从蛋白酶K法,酚-氯仿法,双蒸水煮沸裂解法中遴选出提取UuDNA的较好方法。方法:分别以双蒸水煮沸裂解法,蛋白酶K法(PK法)及酚-氯仿提取法提取UuDNA模板并作比较。结果:PK法及酚-氯仿提取法比较两法无差异,双蒸水煮沸裂解法与酚-氯仿提取法比较前者敏感率较低。结论:应用PCR检测Uu,PK法及酚-氯仿法均可用于UuDNA模板的提取,而双蒸水煮沸裂解法不主张应用。
[关键词] 解脲脲原体;检测;模板制备;PCR
解脲脲原体(Ureaplasma urealyticum, Uu)属脲原体(Ureaplasma),无细胞壁及前体,细胞器极少,由于Uu通过性接触、分娩时经产道等途径传播,故而Uu感染引起的疾病也被列为STD疾病范畴。
研究Uu与疾病的关系最早是从非淋病性尿道炎开始的。近年来,大量研究证实:Uu与非淋病性尿道炎、前列腺炎、睾丸炎、尿结石、膀胱结石、妇科疾病、新生儿低体重、新生儿肺炎等多种疾病有关。由此,Uu对人体健康的危害不容忽视,有必要对其进行检测和治疗。
目前,Uu检测的方法主要有培养法、PCR法等。对于PCR方法检测Uu,关键环节之一是UuDNA的提取。而对于UuDNA的提取成功与否,DNA提取方法的选择至关重要。由于Uu属原核微生物,其细胞特性与细菌相似,故结合文献报道[1~3]选取三种方法(经典的酚-氯仿提取法、PK法及双蒸水煮沸裂解法)作为候选方法提取UuDNA,扩增后对其结果进行比较,以遴选出提取UuDNA的较好方法。
1 资料与方法
1.1 标本来源与采集
全部检测对象来自于性病科、妇产科、泌尿外科。标本采集:男性,以一次性无菌拭子深入尿道2 cm~3 cm处取尿道分泌物(轻轻转动并停留10 s后取出);女性,以一次性无菌拭子在宫颈口处取上皮细胞。其中,男性29例;女性33例,合计62例。
1.2 UuDNA模板的制备
1.2.1 双蒸水煮沸裂解法
标本加入500 μl双蒸水14 000 r/min离心20 min,弃上清。加入500 μl双蒸水,100 ℃煮沸20 min,离心(15 000 r/min,10 min )。取上清液加入500 μl 0.6体积冷异丙醇,0.1体积3 mol乙酸钠(pH 4.8), 4 ℃离心去上清液。沉淀用70%乙醇洗涤,真空干燥。加入TE液100 μl溶解。-20℃或4℃保存。
1.2.2 PK法
标本加入500 μl双蒸水14 000 r/min离心20 min; 弃上清,加300 μl裂解液及2.0 mg/ml蛋白酶K 100 μl,55 ℃孵育1 h后,98 ℃作用20 min。加入400 μl 0.6体积冷异丙醇,0.1体积3 mol pH 4.8乙酸钠,4 ℃离心去上清液。沉淀用70%乙醇洗涤,真空干燥。加入TE液100 μl溶解。-20℃或4℃保存。
1.2.3 酚-氯仿提取法
标本加入500 μl双蒸水14 000 r/min离心20 min; 弃上清。加入500 μl裂解液(含1/10体积酚),(65 ℃预热),95 ℃10 min。加入等体积苯酚-氯仿-异丙醇,65℃放置30 min,间隔5 min~10 min轻摇一次, 离心(15 000 r/min,5 min)。取上层水相加入等体积的氯仿-异丙醇液65 ℃放置30 min,间隔5 min~10 min轻摇一次, 离心(15 000 r/min,5 min )。取上层水相加入0.6体积冷异丙醇,0.1体积3 M pH 5.2乙酸钠,放置30 min,4 ℃,离心15 000 rpm,5 min去上清液。沉淀用70%冷乙醇洗涤,真空干燥。加入TE液100 μl溶解。-20 ℃或4 ℃保存。
1.3.2 PCR检测
三种方法制作的模板分别以PCR扩增。扩增结束后每EP管加入6×载样缓冲液10 μl,混匀。取10 μl混合DNA样品加入2%含溴化乙锭琼脂糖凝胶电泳(5 V/cm)30 min~40 min。紫外灯下观察结果并以凝胶成像系统保存图像。
2 结果
2.1 酚-氯仿法法与双蒸水煮沸裂解法的比较
两者相比较χ2=4.900 ,P=0.026 3 。Plt;0.05。差异有统计学意义。结果表明:酚-氯仿法提取DNA模板Uu阳性检出率高于应用双蒸水煮沸裂解法提取DNA模板的Uu阳性检出率,见表1。表1 酚-氯仿法与双蒸水煮沸裂解法扩增Uu的结果酚-氯仿法 双蒸水煮沸裂解法 (略)
2.2 酚-氯仿法法与PK法的比较
两
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