乳腺癌基因药物网络模型的构建与分析.pdf

JsouthMeduni ·】7D· v，2016，3612)：170—179 技术方法 乳腺癌基因药物网络模型的构建与分析 魏星∽一，胡德华。2，易敏寒1，常雪莲4，朱文婕3，曲少玲1，邓端英1 学教研室，安徽蚌埠233003 摘要：目的构建乳腺癌基因药物网络模型，提取并预测乳腺癌相关基因药物间的关联。方法基于“ABC理论”和关联规则，提 出一种生物实体间关联算法，以乳腺癌为例，提取乳腺癌相关基因与基因、药物与药物、基因与药物3种不同层次的关联，采用R 语言实现网络模型的可视化，最后利用I的C曲线验证算法可靠性。结果得到乳腺癌相关基因185种，98种不同关联；乳腺癌相 关药物97种，170种不同关联；乳腺癌相关基因与药物网络中含有127种基因和77种药物，共384种不同关联。结论乳腺癌的 基因药物之间存在大量不同强度的关联，并且发现一些具有高度关联但尚未验证的生物实体对，为乳腺癌个性化诊治提供了新 的研究思路。 关键词：乳腺癌；基因；药物；网络模型；R语言 Constrllctionand ofabreastcancer networkmodel analysis gene-dmg wEj D如“n1 0Y了Mm^n玎1，cHANGx“P妇九?zHu xi竹旷”，Hu wa巧i矿，Qus矗日of砌91，D￡NGD“册yi竹∥ 1胁sf打“埘J穆加rm日肋玎sec“ri坷册dB喀DⅡf口，2schoofo厂P“圳记H∞{fh，c翻fmf P“自ffc cD“rs巧，4 D印口rf蜥e行f矿MicrobiDf9鲥口删P口msifofog吵BP馏觇MPd砌fcoffE弘Ben驴“233003，@inn Toconstmcta cancer ne卅orkmodelfor and mecorrelations Abs叽ct：objectiVe breast gene-dmg ex打actingPredicting cancer—relatedand We an basedontheABC and(he bet’忙enbreast genesdmgs．MetlIodsdevelopedalgorithm principle breast constmcted3diffbrent assoda廿onmlestoobtaintheco玎．elaHonsbetweenthe entities．Forcancer，we biolo豇cal and u舱dtheR to theassodatednetworkmodel．The correlations(gene—gene，drllg·dmggene—dmg)andlanguageiInPlement me wasveri雠dROCcurve．ResIlltsWeidentified185breast and98 reh曲ilit、，ofa1譬orimm bv cancer-a鹞odated譬enes cancer networkcontained127 assoda石onsbet、们*nmem，97druzsand170assoda石onsbetweenmem．Thebreast genes—dmZs