454测序技术在医学昆虫研究中应用.pdfVIP

第 员怨 卷第 圆 期 寄生虫与医学昆虫学报 灾燥造郾员怨，晕燥郾圆 圆园员圆 远 允怎灶援 ，圆园员圆 年 月 粤糟贼葬 孕葬则葬泽蚤贼燥造援 酝藻凿援 耘灶贼燥皂燥造援 杂蚤灶援  凿燥蚤：员园郾猿怨远怨辕 躁援蚤泽泽灶援员园园缘 园缘园苑援圆园员圆援园圆援园园愿 源缘源 测序技术在 医学 昆虫研究中的应用  摇 摇 摇 摇 摇 周小洁 伶 颖 钱 坤 曾晓亢 （ ， 摇 员园园园员猿） 北 京 市疾 病 预 防控制 中心 北 京 摘要摇 医学昆虫是具 有医学和 经 济 双 重意义的重要 媒介 生物 ，严 重 影响 人 们 生活 质 量 与 身 体健 康 。防制 技 （ 、 ） ， 术 的进步 是基于对其生物学认识 如 生态 习性 生理 特 点 的深 入 但 目前 从 基 因组 角 度的 了解 却 知 之 甚 少 。为此 ，研究人 员 采 用 下 一代高通 量 测 序 技 术从 组学 角 度 进行 研究 ，其中 源缘源 焦磷 酸 测 序 技 术 兼 具 经 济 性与 读 长 最 长的 特 点 ，尤 其 适 合 于无参考 基 因组的 非 模式医学昆虫应用 。本文 简 介 了 源缘源 测 序 原 理 ，主 要 从 技 术 特 点 、应用 范 围等 角度将其与 杂燥造藻曾葬测 序 、基 因芯 片技 术 进行 比较 ；综 述 了近 期在医 学 昆 虫 领 域 取 得 的研究结果 ，包 括抗 药 性分子机 制 、虫媒 病原体检测 、系统发 育 及分 类鉴 定 、重要生理 功 能 相 关 转 录谱 分 析 等 ，以期为其在更多媒介 生物中的应用 提供 指导 。 关键词摇 医学昆虫 ；源缘源 焦磷 酸测序 ；基 因芯 片 ；高通量 ；转 录组 摇 摇 阅晕粤 测 序 （阅晕粤 泽藻择怎藻灶糟蚤灶早 ）作 为 一 种 重 而 随着分子生物学技术 高速发展 ，使得人们从 基 要的 实 验 技 术 ，在 生 物 学 研 究 中 有 着 广 泛 的 应 因角度对生物重 新认识 从而 进行 更有 效 地 防制 ， 。 阅晕粤 ，杂葬灶早藻则 。 用 在 双 螺 旋 结 构 发 现 后 不 久 等 例 如 冈 比亚按 蚊 与埃及伊蚊 基 因组测 序 对一物 （员怨苑缘）提 出用 加 减 法 对 阅晕粤 进 行 测 序 ，首 次 种进行基 因组测 序往往需要 政府 牵 头投入 巨大资 使 用 特异 引物在 阅晕粤 聚合 酶作用 下 进行 延 伸 反 金 ，由于媒介 昆虫种类 繁 多 ，基 因组测 序耗费 巨 应 、碱基 特异性的链 终止 以及采用 聚丙烯酚胺凝 大 ，且测 序 获得 大量 内含子、重 复序列 等非 编码 胶 区分长 度 差 一 个 核 昔 酸 的 单 链 阅晕粤。在 此 基 信 息 ，转 录本 的编码 区所 占比例极低 。因此 ，科 ，酝葬曾葬皂 （员怨苑苑 ） ， 础上 等 年 提 出了化学 降解 法 学家将下一代测序技术应用于医学昆虫 转 录组研 同年 ，杂葬灶早藻则发明 了具 有里程碑 意义的 双脱 氧末 究 ，而焦磷 酸测序技术由 于其读 长较长 而成 为一 端终止测序 法 ，取代 前二 者 成 为